More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3019 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  72.07 
 
 		 451 aa  639    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 424 aa  872    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  68.78 
 
 		 427 aa  623  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  70.89 
 
 		 428 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2289  adenylosuccinate synthetase  63.06 
 
 		 426 aa  568  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2266  adenylosuccinate synthetase  63.62 
 
 		 425 aa  535  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  57.88 
 
 		 429 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  57.65 
 
 		 429 aa  490  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  55.29 
 
 		 432 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  55.76 
 
 		 430 aa  478  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  55.06 
 
 		 432 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  54.59 
 
 		 442 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  53.88 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  53.88 
 
 		 431 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  54.25 
 
 		 435 aa  465  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  54.48 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  54.01 
 
 		 435 aa  463  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  54.72 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  53.41 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  54.48 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  52.59 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  52.59 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  53.77 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  53.77 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  53.66 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  53.77 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  53.77 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  53.77 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3291  adenylosuccinate synthetase  53.54 
 
 		 431 aa  448  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000376094  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  53.9 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  53.77 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  54.01 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  53.77 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000682785  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  53.77 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  52.59 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  53.77 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  53.07 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  53.77 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  52.96 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  53.54 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  53.54 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  52.96 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  53.54 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  53.65 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  53.54 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  53.54 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  53.18 
 
 		 432 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  52.96 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  53.54 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  53.07 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  52.96 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  52.25 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  53.07 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 		 428 aa  443  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  53.21 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4219  adenylosuccinate synthetase  53.07 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  52.13 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  51.03 
 
 		 438 aa  443  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  53.54 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  53.07 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  53.07 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  51.74 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 		 434 aa  438  9.999999999999999e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  50.83 
 
 		 428 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 431 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  52.71 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  52.83 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  50.23 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 		 432 aa  438  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  52.47 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  50.94 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 		 430 aa  431  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  52.36 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  51.97 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 430 aa  431  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 424 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 429 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  51.97 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  52.94 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  52.71 
 
 		 432 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  52.94 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>