More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2659 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2659  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  54.42 
 
 		 219 aa  238  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  49.1 
 
 		 222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  50.7 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  50.7 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2385  phosphate uptake regulator, PhoU  48.15 
 
 		 221 aa  222  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.041607  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0880  phosphate uptake regulator, PhoU  45.91 
 
 		 226 aa  203  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0701467 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1909  phosphate uptake regulator, PhoU  40.93 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.553702  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1604  phosphate uptake regulator, PhoU  45.02 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0382  phosphate uptake regulator, PhoU  40.47 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0872291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  41.78 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  38.6 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  41.43 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  37.26 
 
 		 229 aa  148  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  39.05 
 
 		 222 aa  148  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  40 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  38.5 
 
 		 223 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  39.23 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  38.5 
 
 		 223 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  39.09 
 
 		 233 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  39.55 
 
 		 233 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.88 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  38.1 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  40.38 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  36.79 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  39.52 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  37.02 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  37.67 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  37.62 
 
 		 223 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  36.57 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  37.14 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  35.68 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  34.74 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  35.68 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  35.92 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.04 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  35.21 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  35.68 
 
 		 253 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  36.65 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.74 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  36.67 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  35.05 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  36.59 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 256 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  37.26 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  35.65 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  36.74 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  34.56 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  35.48 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  34.6 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  35.24 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  34.26 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  35.58 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  35.02 
 
 		 240 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  37.25 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  32.51 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.06 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.06 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  36.23 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  36.06 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 217 aa  121  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  32.57 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  34.13 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  32.52 
 
 		 220 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  35.94 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  34.6 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  37.14 
 
 		 218 aa  118  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  34.6 
 
 		 236 aa  118  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  36.19 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  35.58 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.65 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  32.08 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  36.67 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  32.08 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.67 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  32.26 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  34.45 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  31.34 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.6 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  30.88 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  32.56 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  34.4 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  34.4 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.19 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.19 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  32.84 
 
 		 256 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.71 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  36.71 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  31.13 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>