More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2000 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 285 aa  566  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  53.85 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  51.93 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  49.82 
 
 		 307 aa  265  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  51.41 
 
 		 315 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 		 308 aa  257  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  44.91 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  44.21 
 
 		 311 aa  245  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  47.41 
 
 		 285 aa  234  8e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  45.22 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  45.13 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  45.79 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  45.07 
 
 		 327 aa  221  8e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  43.55 
 
 		 328 aa  215  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  45.77 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  40.15 
 
 		 305 aa  204  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  39.01 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  41.07 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  40.75 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  39.22 
 
 		 346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  40.98 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  40.71 
 
 		 315 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  37.92 
 
 		 305 aa  191  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  39.26 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  38.66 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  40.78 
 
 		 376 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  40.71 
 
 		 315 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  38.35 
 
 		 308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  38.75 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  38.75 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  39.56 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  40.75 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  38.29 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  42.26 
 
 		 295 aa  175  9e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  38.01 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  38.66 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  36.47 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  36.63 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  31.84 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  39.62 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  37.78 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  41.03 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  34.52 
 
 		 299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  38.21 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  38.21 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  35.51 
 
 		 303 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.4 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  37.45 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  33.22 
 
 		 318 aa  162  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  34.59 
 
 		 330 aa  161  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  38.58 
 
 		 317 aa  161  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  36.09 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  35.96 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  35.96 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  35.96 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  35.96 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  36.74 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  35.58 
 
 		 300 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  38.64 
 
 		 302 aa  158  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  36.33 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  36.33 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  36.33 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  36.33 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  36.33 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  36.33 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  36.33 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  36.33 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  37.64 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  35.98 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  38.11 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  35.23 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  35.71 
 
 		 301 aa  151  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  37.12 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  36.36 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  34.7 
 
 		 325 aa  148  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  36.74 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  33.58 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  37.11 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  36.74 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  34.98 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  34.72 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  37.11 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  36.36 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 		 331 aa  145  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  28.93 
 
 		 337 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  34.21 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>