53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1259 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  100 
 
 
412 aa  839    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  40.69 
 
 
362 aa  189  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  29.77 
 
 
331 aa  100  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  27.27 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  30.07 
 
 
353 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  31.34 
 
 
340 aa  87.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  29.81 
 
 
348 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.48 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  28.26 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  28.76 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.37 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.67 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.96 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  27.67 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  31.62 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  26.89 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.55 
 
 
364 aa  72  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  28.14 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  27.72 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  28.41 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  28.04 
 
 
369 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  28.09 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  31.79 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  28.57 
 
 
372 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  27.27 
 
 
332 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  28.79 
 
 
372 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  24.91 
 
 
351 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  26.88 
 
 
342 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  28.03 
 
 
372 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.42 
 
 
367 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  28.03 
 
 
379 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  27.08 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  24.55 
 
 
351 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  26.51 
 
 
365 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  25.64 
 
 
387 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.85 
 
 
360 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.57 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  22.97 
 
 
352 aa  53.9  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.62 
 
 
361 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  25.83 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  25.83 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  25.83 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.06 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  23.94 
 
 
381 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.37 
 
 
347 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  25.11 
 
 
489 aa  47.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  30.1 
 
 
379 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  23.23 
 
 
354 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  23.23 
 
 
354 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.29 
 
 
418 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.26 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  23.74 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  23.74 
 
 
353 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>