More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1318 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1318  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 
468 aa  932    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.201622  normal  0.0337252 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2332  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60.73 
 
 
500 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141382  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.79 
 
 
490 aa  525  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0934  ABC transporter, inner membrane subunit  57.32 
 
 
470 aa  477  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1669  oligopeptide ABC transporter permease protein  58.86 
 
 
468 aa  471  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111117  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1184  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.46 
 
 
457 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2062  oligopeptide ABC transporter, permease protein  50.32 
 
 
465 aa  428  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1752  ABC type ATPase  50.32 
 
 
480 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487348  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1266  peptide ABC transporter, permease protein, putative  56.05 
 
 
462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394823  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.26 
 
 
492 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.233284 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0990  hypothetical protein  49.65 
 
 
448 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1023  hypothetical protein  49.06 
 
 
448 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0204  hypothetical protein  38.33 
 
 
286 aa  168  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0213  hypothetical protein  38.33 
 
 
286 aa  168  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 
306 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
307 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 
306 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  36.48 
 
 
307 aa  160  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.48 
 
 
307 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 
307 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
307 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  37.3 
 
 
307 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 
307 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2825  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
365 aa  156  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.151241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
312 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  36.89 
 
 
307 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  36.89 
 
 
307 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
285 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  36.1 
 
 
304 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  36.1 
 
 
304 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
341 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.969826  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  34.87 
 
 
288 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
285 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3928  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  36.63 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.95 
 
 
284 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3693  IM pore protein  38.33 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.718363  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
280 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1069  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  32.37 
 
 
338 aa  146  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
307 aa  146  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
280 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0433  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
313 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0859322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
293 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
313 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000513127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
327 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.345661  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
274 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1822  oligopeptide transport integral membrane protein  35.2 
 
 
341 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.661927  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26190  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.71 
 
 
325 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.16491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
258 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.289806  normal  0.295413 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
558 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00968979  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0445  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems permease components-like  35.22 
 
 
351 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.881548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.99 
 
 
288 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
363 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.960083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 
282 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15550  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.71 
 
 
396 aa  143  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.409579  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
542 aa  143  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
355 aa  143  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0423435  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
532 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.180791  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  34.54 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 
285 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.390668  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0571  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.61 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
278 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
364 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853093  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
348 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0562507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
321 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
280 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
494 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
344 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
308 aa  140  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.810845 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
305 aa  139  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
378 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
485 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
349 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
497 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
334 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.825229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1851  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.51 
 
 
331 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.737422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
299 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
285 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  34.31 
 
 
473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
495 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.844451  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4163  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.82 
 
 
372 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0546516  hitchhiker  0.0000167593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
496 aa  137  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
300 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.641847 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
352 aa  137  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000439393  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
284 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
325 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.54 
 
 
650 aa  137  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
299 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
319 aa  136  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
390 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
356 aa  136  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
356 aa  136  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>