More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4519 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4519  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 351 aa  699    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.26 
 
 		 349 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0338  alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  32.66 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  31.9 
 
 		 345 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  32.48 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10170  L-threonine 3-dehydrogenase  33.52 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4973  L-threonine 3-dehydrogenase  31.03 
 
 		 342 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554494  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  30.77 
 
 		 345 aa  159  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1853  L-threonine 3-dehydrogenase  28.74 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.981388  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3116  L-threonine 3-dehydrogenase  31.03 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.717555 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  30.48 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  31.71 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  30.48 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  30.77 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.31 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.64 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.64 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.34 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  31.14 
 
 		 345 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.64 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  31.23 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  34.34 
 
 		 340 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.34 
 
 		 340 aa  156  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0006  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  34.34 
 
 		 340 aa  156  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  34.34 
 
 		 340 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.34 
 
 		 340 aa  156  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  29.23 
 
 		 342 aa  156  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  35.83 
 
 		 352 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 		 349 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  31.43 
 
 		 345 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  30.17 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  30.77 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5320  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  28 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5157  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4535  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5702  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  29.89 
 
 		 342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3178  L-threonine 3-dehydrogenase  30.17 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  29.89 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  28 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  31.61 
 
 		 344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  27.79 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  27.79 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.36 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  33.74 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2797  L-threonine 3-dehydrogenase  33.24 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2923  L-threonine 3-dehydrogenase  31.43 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  30.37 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.78 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  26.86 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.06 
 
 		 357 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  26.44 
 
 		 343 aa  150  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.1 
 
 		 348 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 		 349 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.03 
 
 		 342 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1028  L-threonine 3-dehydrogenase  34.28 
 
 		 347 aa  149  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.44 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.45 
 
 		 336 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  28 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  27.59 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.84 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0233  L-threonine 3-dehydrogenase  27.48 
 
 		 345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.43371 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  27.01 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  28.16 
 
 		 343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.13 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  27.71 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.54 
 
 		 347 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  27.3 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  27.3 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3023  L-threonine 3-dehydrogenase  32.09 
 
 		 348 aa  146  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473403  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7063  L-threonine 3-dehydrogenase  34.1 
 
 		 344 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  30.46 
 
 		 345 aa  146  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  32.27 
 
 		 363 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  27.43 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  27.87 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  28.61 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  26.29 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2686  L-threonine 3-dehydrogenase  30.66 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00603723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  31.71 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  26.86 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>