36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3681 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  100 
 
 
526 aa  1065    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  50.8 
 
 
699 aa  482  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  31.95 
 
 
453 aa  196  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  33.96 
 
 
451 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  32.02 
 
 
453 aa  193  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  32.12 
 
 
451 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  31.19 
 
 
454 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  31.52 
 
 
457 aa  177  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  31.82 
 
 
438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  32.31 
 
 
429 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  31.18 
 
 
438 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  28.27 
 
 
998 aa  113  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  29.48 
 
 
1844 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  26.8 
 
 
1175 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  28.92 
 
 
512 aa  98.2  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  26.91 
 
 
513 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  27.09 
 
 
513 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  25.68 
 
 
513 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  26.43 
 
 
513 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  27.17 
 
 
472 aa  89.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  27.03 
 
 
461 aa  87.8  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  28.29 
 
 
2852 aa  85.9  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  25.69 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  31.43 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  28.29 
 
 
945 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.24 
 
 
3977 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  26.94 
 
 
494 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  23.83 
 
 
510 aa  55.1  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  25.71 
 
 
504 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  26.96 
 
 
494 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  25.07 
 
 
466 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  23.93 
 
 
495 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  25.79 
 
 
452 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  24.26 
 
 
495 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  28.52 
 
 
469 aa  43.9  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  22.81 
 
 
487 aa  43.5  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>