23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0542 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0542  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  759    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884235 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3872  hypothetical protein  63.09 
 
 		 386 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3145  hypothetical protein  61.98 
 
 		 386 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0315  hypothetical protein  64.55 
 
 		 352 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.392755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1870  hypothetical protein  64.09 
 
 		 347 aa  421  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4487  hypothetical protein  62.63 
 
 		 376 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5075  hypothetical protein  65.6 
 
 		 352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0461  hypothetical protein  61.67 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0769  hypothetical protein  49.27 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3936  hypothetical protein  37.1 
 
 		 350 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2084  hypothetical protein  39.28 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0973  hypothetical protein  39.28 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500079  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2306  hypothetical protein  39.39 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2272  hypothetical protein  39.55 
 
 		 360 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.143558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2140  hypothetical protein  39.55 
 
 		 360 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0419324  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0212  hypothetical protein  36.21 
 
 		 380 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3857  hypothetical protein  36.23 
 
 		 356 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5880  hypothetical protein  36.39 
 
 		 356 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0647392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4140  hypothetical protein  26.52 
 
 		 408 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.23808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3718  hypothetical protein  37.29 
 
 		 169 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1392  hypothetical protein  30 
 
 		 413 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0748724  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3230  hypothetical protein  35.59 
 
 		 169 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3672  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1187 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>