16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3672 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3672  hypothetical protein  100 
 
 		 1187 aa  2302    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1060  hypothetical protein  60.66 
 
 		 1344 aa  902    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.362047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  37.27 
 
 		 631 aa  146  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  36.28 
 
 		 705 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1193  hypothetical protein  33.81 
 
 		 882 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0456598  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4754  hypothetical protein  31.37 
 
 		 689 aa  95.1  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1396  Fibronectin type III domain protein  29.23 
 
 		 898 aa  57  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0142323  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1521  FHA domain-containing protein  41.27 
 
 		 295 aa  53.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111872  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0047  hypothetical protein  26.59 
 
 		 611 aa  50.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0056  hypothetical protein  26.59 
 
 		 666 aa  50.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.266477  normal  0.020844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6999  fibronectin type III domain-containing protein  26.3 
 
 		 915 aa  50.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1872  hypothetical protein  24.94 
 
 		 866 aa  50.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0047456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0037  hypothetical protein  26.59 
 
 		 666 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0543  Fibronectin type III domain protein  26.83 
 
 		 928 aa  49.7  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2708  FHA domain containing protein  36.78 
 
 		 263 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.042803  hitchhiker  0.0000000030829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4216  FHA domain-containing protein  37.04 
 
 		 287 aa  45.8  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000473857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>