26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2456 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2456  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  100 
 
 
707 aa  1457    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0527  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  60.65 
 
 
701 aa  845    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.277952  hitchhiker  0.00233438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1712  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  51.91 
 
 
726 aa  704    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000991521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0510  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  60.93 
 
 
701 aa  850    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4165  DEAD/DEAH box helicase-like  31.81 
 
 
725 aa  281  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750963  decreased coverage  0.0000030126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1861  DEAD/DEAH box helicase-like  24.29 
 
 
692 aa  96.3  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3576  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  23.93 
 
 
717 aa  94.7  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1557  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.66 
 
 
696 aa  88.6  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.476169  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  26.47 
 
 
741 aa  72.4  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  27.68 
 
 
799 aa  60.8  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  26.03 
 
 
828 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1323  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.89 
 
 
701 aa  55.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.122817  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1130  CRISPR-associated helicase Cas3  31.78 
 
 
484 aa  55.1  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.566475  normal  0.71889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2231  helicase superfamily protein  26.16 
 
 
778 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  24.47 
 
 
873 aa  52.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.22 
 
 
724 aa  50.1  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  29.59 
 
 
729 aa  49.3  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.21 
 
 
970 aa  49.3  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  29.86 
 
 
764 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0124  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.3 
 
 
692 aa  46.2  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.68 
 
 
764 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  28.83 
 
 
881 aa  45.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.07 
 
 
764 aa  45.8  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.97 
 
 
488 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.5 
 
 
806 aa  44.3  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  22.67 
 
 
854 aa  43.9  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>