50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0674 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0674  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  828    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.812406  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4827  hypothetical protein  53.1 
 
 
415 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2166  hypothetical protein  52.3 
 
 
456 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0291  hypothetical protein  53.28 
 
 
412 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.544932  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0291  hypothetical protein  53.28 
 
 
412 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0929  hypothetical protein  51.18 
 
 
446 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4965  hypothetical protein  46.64 
 
 
453 aa  360  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252399  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0121  hypothetical protein  51.11 
 
 
408 aa  353  4e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0164  hypothetical protein  37.41 
 
 
404 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172783  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1920  hypothetical protein  39.8 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00171582  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17731  hypothetical protein  31.77 
 
 
435 aa  226  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20341  hypothetical protein  35.71 
 
 
437 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.433263  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22611  hypothetical protein  39.75 
 
 
480 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1159  hypothetical protein  35.34 
 
 
406 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1678  hypothetical protein  33.75 
 
 
470 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.247818  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17781  hypothetical protein  34.41 
 
 
434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17941  hypothetical protein  33.91 
 
 
453 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.392703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2222  hypothetical protein  35.1 
 
 
398 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.0837623 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17071  hypothetical protein  36.47 
 
 
471 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4077  hypothetical protein  34.69 
 
 
398 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4116  hypothetical protein  34.69 
 
 
398 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0409  hypothetical protein  37.31 
 
 
395 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.321812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2397  hypothetical protein  35.34 
 
 
404 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.712656  normal  0.628549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2386  hypothetical protein  32.94 
 
 
401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2437  hypothetical protein  32.94 
 
 
401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.318541 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0676  hypothetical protein  35.85 
 
 
401 aa  189  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.504662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3502  hypothetical protein  34.21 
 
 
418 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1973  hypothetical protein  33.73 
 
 
387 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.945565  normal  0.0601729 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26251  hypothetical protein  34.66 
 
 
403 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2727  hypothetical protein  33.33 
 
 
401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0121  hypothetical protein  29.19 
 
 
403 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2359  hypothetical protein  32.53 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01351  hypothetical protein  30.11 
 
 
400 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01361  hypothetical protein  29.56 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01341  hypothetical protein  30.26 
 
 
407 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519347  normal  0.379987 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01321  hypothetical protein  27.12 
 
 
396 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2931  hypothetical protein  33.92 
 
 
392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.715208  normal  0.790346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1624  hypothetical protein  31.22 
 
 
397 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0332  hypothetical protein  30.38 
 
 
393 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  30.22 
 
 
771 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0563  hypothetical protein  32.37 
 
 
413 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  25.49 
 
 
384 aa  57.4  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  23.72 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1699  hypothetical protein  23.77 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000568429  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0540  hypothetical protein  23.11 
 
 
413 aa  46.6  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  25.5 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  25.51 
 
 
381 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  22.97 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  26.21 
 
 
384 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0123  hypothetical protein  68 
 
 
29 aa  43.5  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>