33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5005 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 255 aa  503  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 115 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.44 
 
 		 138 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  37.68 
 
 		 122 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 124 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.53 
 
 		 149 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  40.35 
 
 		 123 aa  48.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  33.33 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 133 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3856  cupin 2, barrel  35.94 
 
 		 123 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.875667 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0016  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  33.78 
 
 		 447 aa  46.6  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1883  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 		 157 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  41.51 
 
 		 177 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  36.23 
 
 		 117 aa  46.2  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.92 
 
 		 118 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 311 aa  45.8  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.31 
 
 		 151 aa  45.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  38.27 
 
 		 234 aa  45.4  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1819  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  30.26 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 125 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.47 
 
 		 121 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 		 129 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2000  hypothetical protein  34.29 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.72 
 
 		 123 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  34.33 
 
 		 122 aa  42.7  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  36.11 
 
 		 115 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  37.5 
 
 		 119 aa  43.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  32.39 
 
 		 122 aa  42.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 127 aa  42.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 266 aa  42  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 113 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>