More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2744 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2744  ABC transporter related protein  100 
 
 
501 aa  959    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  41.06 
 
 
503 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2594  ABC transporter related  45.31 
 
 
493 aa  362  6e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98451  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  40.36 
 
 
501 aa  355  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  44.23 
 
 
508 aa  353  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2667  ABC transporter related  42.91 
 
 
505 aa  348  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  38.6 
 
 
501 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  40.52 
 
 
501 aa  346  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  38.96 
 
 
501 aa  345  8.999999999999999e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  39.96 
 
 
501 aa  342  9e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  37.85 
 
 
501 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  37.1 
 
 
495 aa  339  7e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  41.52 
 
 
500 aa  338  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  44.24 
 
 
500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  41.21 
 
 
585 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 
515 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  41.37 
 
 
505 aa  336  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  35.34 
 
 
496 aa  336  5e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  41.56 
 
 
504 aa  336  5e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  39.47 
 
 
516 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  39.27 
 
 
506 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 
515 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0397  ABC transporter related  46.04 
 
 
502 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 
515 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  34.97 
 
 
507 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 
515 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  39.24 
 
 
501 aa  333  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  39.24 
 
 
501 aa  333  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  39.19 
 
 
525 aa  333  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 
519 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  39.24 
 
 
501 aa  333  4e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  39.02 
 
 
537 aa  333  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  44 
 
 
502 aa  333  5e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  37.02 
 
 
492 aa  333  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  39.24 
 
 
501 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  39.24 
 
 
501 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  39.24 
 
 
501 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  39.27 
 
 
516 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  39.27 
 
 
516 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  39.27 
 
 
516 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  38.76 
 
 
494 aa  332  9e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  42.06 
 
 
517 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  39.27 
 
 
501 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  42.06 
 
 
517 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  39.24 
 
 
501 aa  332  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  41.65 
 
 
517 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 
517 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  41.65 
 
 
517 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  39.24 
 
 
501 aa  331  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  37.05 
 
 
501 aa  331  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  38.23 
 
 
509 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  41.87 
 
 
517 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.45 
 
 
519 aa  330  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2759  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.09 
 
 
512 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0843  ABC transporter related  43.35 
 
 
496 aa  330  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.0750454 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  39.47 
 
 
497 aa  330  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  36.97 
 
 
497 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2994  ABC transporter related  43.09 
 
 
512 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.47 
 
 
522 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3938  ABC transporter related protein  42.51 
 
 
839 aa  330  5.0000000000000004e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.649029  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0593  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.02 
 
 
514 aa  329  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  38.48 
 
 
500 aa  329  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  42.04 
 
 
517 aa  329  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.6 
 
 
544 aa  329  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  35.98 
 
 
496 aa  329  9e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  35.74 
 
 
496 aa  329  9e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  39.52 
 
 
512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.28 
 
 
520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  38.55 
 
 
499 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  38.87 
 
 
507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  38.86 
 
 
505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.07 
 
 
495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  34.5 
 
 
499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  37.48 
 
 
501 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.87 
 
 
507 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  38.18 
 
 
500 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  36.65 
 
 
505 aa  327  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  38.55 
 
 
499 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  39.56 
 
 
501 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3057  ABC transporter related  44 
 
 
505 aa  327  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.242783  hitchhiker  0.00700396 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  38.87 
 
 
507 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.87 
 
 
517 aa  326  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  37.89 
 
 
499 aa  326  7e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  40.08 
 
 
544 aa  325  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.87 
 
 
517 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  40.65 
 
 
497 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.87 
 
 
517 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.87 
 
 
517 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0775  xylose transporter ATP-binding subunit  36.93 
 
 
512 aa  324  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  35.67 
 
 
503 aa  324  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  37.22 
 
 
499 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2738  ABC transporter related protein  43.23 
 
 
520 aa  323  6e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3109  ABC transporter related  35.73 
 
 
500 aa  323  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00977673  hitchhiker  0.0000567489 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  40.4 
 
 
511 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  36.79 
 
 
495 aa  322  8e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  38.48 
 
 
511 aa  322  8e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  38.07 
 
 
518 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  40.89 
 
 
503 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.95 
 
 
525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  38.46 
 
 
510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>