61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2025 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2025  resolvase helix-turn-helix region containing protein  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.122452  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  29.45 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  30.14 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  28.77 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2201  resolvase  28.17 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  27.74 
 
 		 219 aa  62  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  25 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  26.9 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  27.59 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  28.17 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  28.17 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  26.21 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  27.94 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  31.69 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  30.63 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  30.63 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  30.63 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  26.32 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  27.59 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  27.5 
 
 		 309 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  27.63 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  26.97 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  26 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  26.03 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  26.38 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  27.67 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0025  resolvase, putative  27.78 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2284  Resolvase domain protein  29.09 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  25.19 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  29.87 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  29.87 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  31.06 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  21.47 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  28.85 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  29.41 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  27.63 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  28 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0151  resolvase  37.5 
 
 		 87 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  25.52 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  29.41 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  25.95 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  25.5 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  30.37 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.66 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  25.69 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  23.17 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  25.13 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0212  resolvase  38.89 
 
 		 69 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171512 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  28.57 
 
 		 188 aa  42  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0119  transposon resolvase  27.27 
 
 		 186 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.336282 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0149  transposon resolvase  27.27 
 
 		 186 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015767 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  23.33 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  23.53 
 
 		 204 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  23.53 
 
 		 204 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  25.66 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  23.97 
 
 		 199 aa  41.2  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  26.28 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  24.69 
 
 		 199 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  25 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  26.58 
 
 		 197 aa  40.8  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  24.52 
 
 		 194 aa  40.8  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>