55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1531 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1531  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  342  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.52 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  32.29 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  37.5 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  32.61 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  33.7 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.91 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.62 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  31.96 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33014  predicted protein  32.89 
 
 		 436 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.111303  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  35.71 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  29.9 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  25.66 
 
 		 214 aa  48.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  48.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  27.17 
 
 		 184 aa  48.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 		 186 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7521  hypothetical protein  29.67 
 
 		 236 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  34.33 
 
 		 185 aa  47.4  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  35.94 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  35.94 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  27.66 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  34.94 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  30.43 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  32.81 
 
 		 208 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  23.78 
 
 		 203 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  32.81 
 
 		 208 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  32.81 
 
 		 208 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.83 
 
 		 203 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  31.88 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  32 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.09 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.34 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  30.3 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  31.34 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  32 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  26.17 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  30.43 
 
 		 205 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  32.88 
 
 		 195 aa  42  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 		 209 aa  42  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.09 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0091  hypothetical protein  27.96 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121116 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00876  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 313 aa  42  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  27.16 
 
 		 180 aa  41.2  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  27.27 
 
 		 202 aa  41.2  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  34.33 
 
 		 204 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.82 
 
 		 194 aa  40.8  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.85 
 
 		 192 aa  40.8  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  25.56 
 
 		 201 aa  40.8  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.72 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  30.12 
 
 		 188 aa  40.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>