26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1471 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 561 aa  1161    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  22.69 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  21.39 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  21.32 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  27.16 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  29.13 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  21.43 
 
 		 551 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  24.49 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  27.07 
 
 		 483 aa  57  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 		 468 aa  57  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  27.86 
 
 		 465 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  27.04 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  22.7 
 
 		 863 aa  54.7  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  23.79 
 
 		 590 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  21.92 
 
 		 853 aa  53.9  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 		 489 aa  53.5  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  24.11 
 
 		 501 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  21.79 
 
 		 335 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  21.5 
 
 		 312 aa  52.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.67 
 
 		 673 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  20.44 
 
 		 335 aa  50.4  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  22.27 
 
 		 332 aa  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  21.72 
 
 		 869 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  22.51 
 
 		 705 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  25.32 
 
 		 573 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>