More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5974 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5974  thioredoxin domain protein  100 
 
 		 102 aa  215  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.897668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  39.78 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  49.41 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  38.71 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  39.78 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  39.78 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  38.71 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  38.71 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  38.71 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  42.35 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  38.71 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  38.71 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  38.71 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  39.53 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  38.71 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  42.35 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  37.63 
 
 		 146 aa  90.5  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  37.63 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  37.63 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  37.63 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  37.63 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  37.63 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  37.63 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  37.63 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  41.18 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  41.18 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  41.18 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  37.23 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  39.78 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  38.71 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  38.71 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  39.78 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  40.86 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  44.44 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  33.71 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  35.48 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  42.39 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  38.37 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  34.44 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  37.63 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  36.96 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  41.18 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  39.56 
 
 		 287 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  33.71 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  33.71 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  37.63 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  41.98 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  36.96 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  38.75 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  35.48 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  35.87 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  35.48 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  34.41 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  36.26 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  43.84 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  43.84 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  34.41 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  45.45 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  37.65 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  39.74 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  34.44 
 
 		 106 aa  83.6  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  34.38 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  37.23 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  35.48 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  37.63 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  35.48 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  36.05 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  37.63 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  37.63 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  34.78 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  39.13 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  35.48 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  32.58 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  42.47 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  36.56 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  37.5 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  34.41 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  32.94 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  38.37 
 
 		 302 aa  81.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  36.47 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  34.04 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  34.41 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  32.99 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  34.04 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  36.56 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  43.66 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  39.36 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  35.29 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  34.04 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  37.65 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  37.63 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  35.48 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  36.17 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  38.1 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>