298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5828 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 383 aa  785    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  56.03 
 
 		 376 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.98 
 
 		 407 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.19 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.15 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  37.23 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.89 
 
 		 375 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  33.99 
 
 		 509 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  33.66 
 
 		 509 aa  155  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.56 
 
 		 526 aa  151  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  37.6 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.35 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  34.56 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  32.17 
 
 		 489 aa  146  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  32.41 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  32.92 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  36.6 
 
 		 547 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  33.86 
 
 		 553 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  35.55 
 
 		 499 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  35.04 
 
 		 552 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  36.59 
 
 		 498 aa  139  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  36.11 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  30.86 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  31.61 
 
 		 543 aa  138  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  33.88 
 
 		 498 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  34.86 
 
 		 523 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  34.71 
 
 		 546 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  34.32 
 
 		 499 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.28 
 
 		 528 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  38.32 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  38.32 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  38.32 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  38.32 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  31.96 
 
 		 553 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.68 
 
 		 477 aa  135  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  37.63 
 
 		 498 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  34.32 
 
 		 498 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  34.32 
 
 		 498 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  30.74 
 
 		 560 aa  134  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  34.32 
 
 		 498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.32 
 
 		 498 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  34.32 
 
 		 498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  34.32 
 
 		 498 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  34.32 
 
 		 498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  34.32 
 
 		 506 aa  133  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  35.42 
 
 		 468 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  34.39 
 
 		 512 aa  133  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  34.39 
 
 		 512 aa  133  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  34.39 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  32.22 
 
 		 498 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  34.63 
 
 		 368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  34.8 
 
 		 368 aa  127  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  38.37 
 
 		 379 aa  125  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  35.61 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  37.16 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.26 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  24.82 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  24 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  23.64 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  24.82 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  24.1 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  24.1 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  24.91 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  25.98 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  27.91 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.21 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  25.91 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  23.64 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.52 
 
 		 325 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.71 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.75 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.55 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  24.47 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.55 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.54 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  28.81 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  26.09 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  24.64 
 
 		 309 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  25.71 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.44 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  25 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.25 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  23.36 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  25.38 
 
 		 326 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  25.38 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.07 
 
 		 331 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  27.27 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  27.27 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  25.36 
 
 		 302 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.52 
 
 		 331 aa  53.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  27.11 
 
 		 318 aa  53.5  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.81 
 
 		 314 aa  53.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  26.16 
 
 		 324 aa  53.1  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  24.7 
 
 		 332 aa  53.1  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  26.51 
 
 		 329 aa  52.8  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  28.74 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  28.74 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  25.75 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  28.74 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  25.23 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>