160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4470 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4470  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  252  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295194  normal  0.0572132 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  34.41 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  31.68 
 
 		 602 aa  72  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  31.13 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  35.64 
 
 		 597 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  36.14 
 
 		 595 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  32.22 
 
 		 607 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  32.22 
 
 		 607 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  31.33 
 
 		 597 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  31 
 
 		 596 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  30.93 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  30.93 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.53 
 
 		 597 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  37.68 
 
 		 598 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  30.91 
 
 		 610 aa  61.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  31.82 
 
 		 343 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  30.3 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  35 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  30.3 
 
 		 597 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  35.35 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1539  hypothetical protein  30.91 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  30 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  29.13 
 
 		 614 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  28.12 
 
 		 677 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.97 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  27.45 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  26.88 
 
 		 562 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 596 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  25.84 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4743  hypothetical protein  32.14 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  28.26 
 
 		 575 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  27.18 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  33.33 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  33.33 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  27.84 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  27.27 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  29.89 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  29.89 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  29.89 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  27.78 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  32.58 
 
 		 635 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  32.14 
 
 		 569 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  31.33 
 
 		 592 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1581  ferredoxin-like protein  25.83 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3087  ferredoxin-like protein  27.45 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389832 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1606  Ferredoxin-like protein  25.83 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  27.55 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2739  2Fe-2S ferredoxin  30.77 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  29.87 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  30.48 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  30.48 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.52 
 
 		 408 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  28.16 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  27.59 
 
 		 572 aa  51.2  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  29.59 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  24.74 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  25.81 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  25.51 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0795  2Fe-2S ferredoxin  28.75 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694243  normal  0.0128842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  26.92 
 
 		 222 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  26.83 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  29.63 
 
 		 636 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  28.28 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  26.51 
 
 		 572 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  25.77 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  29.63 
 
 		 636 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3789  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.56 
 
 		 273 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.040957  normal  0.896833 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  27.78 
 
 		 614 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  25.27 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  33.77 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  32.63 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  32.63 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  24.53 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  29.9 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  28.74 
 
 		 596 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  29 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  28.74 
 
 		 226 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  29 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30 
 
 		 410 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  30.43 
 
 		 623 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  25 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  30.21 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  27.27 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  25.42 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  24.74 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  24.74 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  30.68 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0729  [Fe] hydrogenase, HymB subunit, putative  23.66 
 
 		 623 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  21.43 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  36.36 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  26.42 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  25 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2241  hypothetical protein  27.06 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  36.84 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  38.46 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  26.92 
 
 		 632 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  25.56 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  24.44 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0030  ferredoxin, 2Fe-2S  26.88 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  30.67 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>