288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2923 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2923  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  100 
 
 
302 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  39.07 
 
 
303 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  39.53 
 
 
303 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  39.07 
 
 
303 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  39.07 
 
 
303 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  40.28 
 
 
303 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  40.28 
 
 
303 aa  228  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  39.37 
 
 
303 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  38.18 
 
 
303 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  38.68 
 
 
303 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  38.54 
 
 
303 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1064  HhH-GPD family protein  37.54 
 
 
300 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  35.22 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3755  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
489 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3470  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
523 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884533  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.79 
 
 
288 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1779  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.78 
 
 
301 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  30.31 
 
 
309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1307  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.96 
 
 
288 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.65 
 
 
287 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0541  HhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein  30.41 
 
 
287 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.256846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0399  DNA-3-methyladenine glycosylase II (3-methyladenine-DNA glycosidase)  29.03 
 
 
287 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0405  HhH-GPD family protein  32.47 
 
 
287 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0541  endonuclease III domain protein  29.95 
 
 
287 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0403  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.49 
 
 
287 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0471  endonuclease III domain protein  29.49 
 
 
287 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0413  DNA-3-methyladenine glycosylase II, C-terminus  30.93 
 
 
213 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4833  endonuclease III domain protein  29.49 
 
 
287 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00136763  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0490  endonuclease III domain protein  29.49 
 
 
287 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2913  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.304572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2560  Ada metal-binding domain-containing protein  32.69 
 
 
581 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1527  HhH-GPD family protein  29 
 
 
322 aa  92.8  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0472301  normal  0.34415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1848  base excision repair protein, HhH-GPD family  29 
 
 
322 aa  92.8  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4053  HhH-GPD family protein  27.8 
 
 
330 aa  92.4  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3357  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  31.08 
 
 
486 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0843  HhH-GPD  28.64 
 
 
205 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392281 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3087  alcohol dehydrogenase  27.93 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00020691  hitchhiker  0.00000000000128814 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2892  HhH-GPD family protein  31.82 
 
 
246 aa  89.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.866657  hitchhiker  0.00930162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3954  AlkA domain protein  28.03 
 
 
305 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0202431  normal  0.626285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1123  HhH-GPD  29.91 
 
 
256 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.754505  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3139  AlkA domain protein  30.58 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3699  HhH-GPD family protein  30.15 
 
 
206 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.297795  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1107  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 
502 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0739915 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1367  Ada metal-binding domain-containing protein  30.8 
 
 
503 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4937  HhH-GPD family protein  31.78 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2508  HhH-GPD family protein  30.65 
 
 
269 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2412  DNA-3-methyladenine glycosylase II  30.15 
 
 
206 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3204  alcohol dehydrogenase  26.19 
 
 
324 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1829  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 
517 aa  86.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1213  HhH-GPD  27.09 
 
 
297 aa  86.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.235749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0086  DNA-3-methyladenine glycosylase II  27.27 
 
 
343 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00010571  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1655  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.8 
 
 
221 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00300264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0323  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26 
 
 
343 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246796  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2823  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  30.56 
 
 
534 aa  86.3  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379129  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0133  DNA-3-methyladenine glycosylase 2  26 
 
 
304 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.221432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6507  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.78 
 
 
319 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000337261  normal  0.0896284 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2455  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.3 
 
 
217 aa  85.5  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2680  base excision DNA repair protein  27.8 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126721  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5383  3-methyladenine DNA glycosylase/8- oxoguaninedna glycosylase  28.57 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1942  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.8 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2864  HhH-GPD  30.81 
 
 
231 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2544  base excision DNA repair protein  27.8 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3088  alcohol dehydrogenase  26.58 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000614886  hitchhiker  0.000862712 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2835  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.67 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0116  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26.22 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00108548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1431  base excision DNA repair protein  27.8 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2301  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.67 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124738  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2163  HhH-GPD family protein  30.63 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338559  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2324  DNA-3-methyladenine glycosylase 2  25.67 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2158  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.8 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2250  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.67 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00101826  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3157  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.8 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2595  base excision DNA repair protein  27.8 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0401886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0117  DNA-3-methyladenine glycosylase II  26 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000127704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3170  alcohol dehydrogenase  25.44 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000626479  decreased coverage  0.000000129498 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2096  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.58 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0044  Ada metal-binding domain-containing protein  24.15 
 
 
513 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6000  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.58 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2077  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.58 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0124  HhH-GPD family protein  31.79 
 
 
210 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2321  HhH-GPD family protein  30.3 
 
 
219 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  hitchhiker  0.0000733182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1101  Ada metal-binding domain-containing protein  29.86 
 
 
511 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12283  normal  0.610277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1168  hypothetical protein  28.64 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0414711  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3037  AlkA domain protein  26.07 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0138739  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1103  HhH-GPD family protein  28.45 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.622773  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2024  alcohol dehydrogenase  31.77 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2538  AlkA-like  25.44 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000684088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2112  HhH-GPD family protein  29.28 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3151  alcohol dehydrogenase  25.44 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000306407  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1982  HhH-GPD family protein  28.83 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  0.532764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  28.97 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1086  HhH-GPD  28.64 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200313  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2252  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  29.38 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1072  transcriptional regulator, AraC family  27.69 
 
 
527 aa  82.4  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2467  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  28.87 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2359  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  29.38 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2308  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  29.38 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113008  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3144  alcohol dehydrogenase  25.94 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000700738  unclonable  0.00000000000553722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1350  HhH-GPD  31.98 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2020  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  30.48 
 
 
517 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.416366  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>