More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1418 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1418  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
845 aa  1747    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  40.2 
 
 
834 aa  625  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1365  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  42.96 
 
 
822 aa  621  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4878  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  44.27 
 
 
863 aa  579  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0576  membrane alanine aminopeptidase (aminopeptidase N)  40.06 
 
 
827 aa  555  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.855112  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  42.41 
 
 
829 aa  520  1e-146  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.89 
 
 
865 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.47 
 
 
858 aa  324  4e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0316  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.05 
 
 
865 aa  320  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670011  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.3 
 
 
866 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.57 
 
 
860 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.02 
 
 
857 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.02 
 
 
857 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5408  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.67 
 
 
905 aa  314  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.93 
 
 
823 aa  283  1e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.44 
 
 
846 aa  283  1e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.96 
 
 
824 aa  277  5e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.92 
 
 
835 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.52 
 
 
822 aa  275  3e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.32 
 
 
821 aa  264  6e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.4 
 
 
823 aa  248  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.02 
 
 
768 aa  203  9e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.33 
 
 
673 aa  184  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.79 
 
 
551 aa  169  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3110  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.65 
 
 
499 aa  161  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351391  hitchhiker  0.0000679571 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.98 
 
 
686 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.21 
 
 
877 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.98 
 
 
517 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4225  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.7 
 
 
471 aa  146  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0777  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.82 
 
 
503 aa  145  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.7 
 
 
470 aa  140  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  30.24 
 
 
688 aa  140  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1060  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.33 
 
 
527 aa  138  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  26.61 
 
 
852 aa  135  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  29.89 
 
 
882 aa  134  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  28.28 
 
 
877 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  26.97 
 
 
858 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21080  aminopeptidase N  25.84 
 
 
446 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  28.04 
 
 
853 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3430  aminopeptidase N  25.16 
 
 
863 aa  133  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42212  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1741  aminopeptidase N  25.55 
 
 
901 aa  132  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00168597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.72 
 
 
859 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  27.06 
 
 
854 aa  132  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  28.05 
 
 
877 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  28.05 
 
 
918 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  28.05 
 
 
877 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0445  aminopeptidase N  26.71 
 
 
878 aa  131  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  27.38 
 
 
877 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  27.55 
 
 
889 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.95 
 
 
687 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0906  aminopeptidase N  25.4 
 
 
881 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5173  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.71 
 
 
442 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0836991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1057  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.95 
 
 
493 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1492  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.48 
 
 
455 aa  129  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03120  aminopeptidase N  26.73 
 
 
509 aa  129  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  27.7 
 
 
877 aa  129  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4787  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.71 
 
 
442 aa  128  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.475246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4873  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.71 
 
 
442 aa  128  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352531  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8546  Aminopeptidase N-like protein  23.66 
 
 
485 aa  128  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  29.1 
 
 
881 aa  127  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  26.36 
 
 
855 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  25.73 
 
 
848 aa  127  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0642  aminopeptidase N  26.84 
 
 
884 aa  127  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411291  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0620  aminopeptidase N  24.83 
 
 
852 aa  127  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  25.99 
 
 
895 aa  127  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  29.92 
 
 
844 aa  127  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0304  aminopeptidase N  26.4 
 
 
877 aa  126  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0182  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.86 
 
 
492 aa  126  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  27.38 
 
 
877 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1403  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.43 
 
 
442 aa  125  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162692  normal  0.473537 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.99 
 
 
852 aa  125  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  27.7 
 
 
887 aa  125  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  27.87 
 
 
869 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6703  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.65 
 
 
538 aa  125  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3232  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.88 
 
 
486 aa  125  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.607549  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0986  aminopeptidase N  28.33 
 
 
849 aa  124  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.977905  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  26.86 
 
 
867 aa  125  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  27.15 
 
 
877 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  26.86 
 
 
867 aa  125  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3603  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.4 
 
 
738 aa  124  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.604033  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4680  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.4 
 
 
738 aa  124  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3781  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.84 
 
 
458 aa  124  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1156  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  27.18 
 
 
875 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165699  normal  0.0390371 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0341  lysyl aminopeptidase  28.41 
 
 
846 aa  124  7e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.39 
 
 
830 aa  124  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1649  aminopeptidase N  27.39 
 
 
888 aa  124  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00465635  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21360  aminopeptidase N  27.62 
 
 
842 aa  123  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5387  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.49 
 
 
448 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.414331  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.14 
 
 
784 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0194  aminopeptidase N  27.99 
 
 
888 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0756  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.39 
 
 
506 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  26.65 
 
 
867 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0930  aminopeptidase N  24.77 
 
 
882 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.182731 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3293  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.16 
 
 
932 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996699  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  27 
 
 
861 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  27.03 
 
 
877 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2201  aminopeptidase N  24.15 
 
 
849 aa  122  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0739  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.27 
 
 
887 aa  122  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.207959  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1079  aminopeptidase N  24.67 
 
 
882 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189522  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0268  aminopeptidase N  24.88 
 
 
880 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>