More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0620 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3068  aminopeptidase N  41.08 
 
 
898 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2201  aminopeptidase N  41.36 
 
 
849 aa  662    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00936  aminopeptidase N  42.36 
 
 
870 aa  682    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00647733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2711  aminopeptidase N  42.36 
 
 
870 aa  682    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02344  aminopeptidase N  41.67 
 
 
868 aa  671    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0668  aminopeptidase N  44.32 
 
 
869 aa  649    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0304  aminopeptidase N  40.69 
 
 
877 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2017  aminopeptidase N  44.76 
 
 
885 aa  753    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.981665  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0774  aminopeptidase N  44.58 
 
 
883 aa  758    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2125  aminopeptidase N  41.56 
 
 
905 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2344  aminopeptidase N  41.48 
 
 
880 aa  644    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2808  aminopeptidase N  42.15 
 
 
872 aa  664    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19807  predicted protein  41.76 
 
 
869 aa  647    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137348  normal  0.504611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2664  aminopeptidase N  42.25 
 
 
870 aa  682    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00436618  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0268  aminopeptidase N  44.11 
 
 
880 aa  737    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2600  aminopeptidase N  41.37 
 
 
849 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3788  aminopeptidase N  44.19 
 
 
888 aa  731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345358  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02005  aminopeptidase N  40.63 
 
 
869 aa  642    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159633  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0439  aminopeptidase N  41.17 
 
 
875 aa  641    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.956932  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2134  aminopeptidase N  42.87 
 
 
859 aa  688    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.258257 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2855  aminopeptidase N  44.12 
 
 
865 aa  730    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2556  aminopeptidase N  43.24 
 
 
871 aa  676    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0655093  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2724  aminopeptidase N  43.31 
 
 
865 aa  721    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2446  aminopeptidase N  40.67 
 
 
849 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1690  aminopeptidase N  43.91 
 
 
888 aa  728    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.325147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1734  aminopeptidase N  43.47 
 
 
871 aa  675    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.357602  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3676  aminopeptidase N  40.76 
 
 
868 aa  675    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2055  aminopeptidase N  45.22 
 
 
885 aa  736    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194007  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1041  aminopeptidase N  42.36 
 
 
870 aa  682    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.230058  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2443  aminopeptidase N  42.54 
 
 
899 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0642  aminopeptidase N  40.71 
 
 
884 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411291  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0899  aminopeptidase N  40.87 
 
 
925 aa  664    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570947  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1102  aminopeptidase N  41.45 
 
 
868 aa  675    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1098  aminopeptidase N  42.71 
 
 
870 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.100576  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1982  aminopeptidase N  43.12 
 
 
871 aa  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.100486  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1314  aminopeptidase N  45.46 
 
 
883 aa  748    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.542169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2200  aminopeptidase N  44.41 
 
 
885 aa  743    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.94331  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0850  aminopeptidase N  38.95 
 
 
885 aa  635    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1649  aminopeptidase N  40.09 
 
 
888 aa  675    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00465635  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1586  aminopeptidase N  42.1 
 
 
852 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109191  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4126  aminopeptidase N  41.35 
 
 
897 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352628  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1223  aminopeptidase N  41.63 
 
 
851 aa  644    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.336507 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2187  aminopeptidase N  42.25 
 
 
870 aa  684    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.739046 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1485  aminopeptidase N  43.66 
 
 
884 aa  665    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.388808  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0620  aminopeptidase N  100 
 
 
852 aa  1751    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1033  aminopeptidase N  42.59 
 
 
870 aa  689    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00218696  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36617  predicted protein  43.14 
 
 
884 aa  686    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000615494  hitchhiker  0.0024222 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2265  aminopeptidase N  42.62 
 
 
900 aa  672    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129158  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0445  aminopeptidase N  42.45 
 
 
878 aa  684    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1015  aminopeptidase N  42.71 
 
 
870 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000603521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2067  aminopeptidase N  44.34 
 
 
880 aa  750    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149086  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3270  aminopeptidase N  41.45 
 
 
871 aa  658    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2482  aminopeptidase N  42.76 
 
 
855 aa  687    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279976  hitchhiker  0.00729308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1549  aminopeptidase N  45.1 
 
 
885 aa  752    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.482315 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1905  aminopeptidase N  40.9 
 
 
849 aa  661    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.136022  normal  0.25158 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1737  aminopeptidase N  43.37 
 
 
890 aa  728    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1238  aminopeptidase N  44.82 
 
 
871 aa  721    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1577  aminopeptidase N  45.28 
 
 
885 aa  758    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.255271  normal  0.230076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0923  aminopeptidase N  41.41 
 
 
898 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1723  aminopeptidase N  41.83 
 
 
852 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148717  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4749  aminopeptidase N  40.6 
 
 
876 aa  666    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2167  aminopeptidase N  43.57 
 
 
877 aa  706    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268834 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2521  aminopeptidase N  41.85 
 
 
879 aa  683    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0876  aminopeptidase N  42.41 
 
 
897 aa  671    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2939  aminopeptidase N  45.1 
 
 
885 aa  723    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0383897  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0706  aminopeptidase N  41.2 
 
 
854 aa  654    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.281728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0475  aminopeptidase N  40.52 
 
 
864 aa  681    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.392595  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1548  aminopeptidase N  41.13 
 
 
875 aa  646    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1119  aminopeptidase N  42.48 
 
 
870 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1996  aminopeptidase N  40.72 
 
 
874 aa  658    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0466032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2104  aminopeptidase N  40.74 
 
 
887 aa  651    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0562697  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0906  aminopeptidase N  40.21 
 
 
881 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1166  aminopeptidase N  42.71 
 
 
870 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.322858  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0884  aminopeptidase N  41.43 
 
 
869 aa  649    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0859653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1451  aminopeptidase N  41.09 
 
 
870 aa  662    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1674  aminopeptidase N  41.11 
 
 
849 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300975  normal  0.663884 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2380  aminopeptidase N  41.35 
 
 
897 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0612557  normal  0.718299 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1936  aminopeptidase N  42.53 
 
 
853 aa  684    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.715788  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1749  aminopeptidase N  41.37 
 
 
849 aa  673    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0219335  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1592  aminopeptidase N  43.17 
 
 
881 aa  699    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491814  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2227  aminopeptidase N  40.51 
 
 
853 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.396627  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2386  aminopeptidase N  42.36 
 
 
870 aa  687    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2754  aminopeptidase N  42.67 
 
 
865 aa  692    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1094  aminopeptidase N  42.59 
 
 
870 aa  689    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0163604  normal  0.415463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24270  aminopeptidase N  45.33 
 
 
885 aa  734    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.626767  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0686  aminopeptidase N  41.15 
 
 
927 aa  646    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2559  aminopeptidase N  41.02 
 
 
849 aa  663    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.841322  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0890  aminopeptidase N  41.24 
 
 
897 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1803  aminopeptidase N  43.22 
 
 
853 aa  694    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0680327  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1741  aminopeptidase N  42.45 
 
 
901 aa  684    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00168597  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0120  aminopeptidase N  40.05 
 
 
903 aa  658    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1132  aminopeptidase N  42.94 
 
 
870 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195305  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2645  aminopeptidase N  43.24 
 
 
871 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142802  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0930  aminopeptidase N  42.14 
 
 
882 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.182731 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2439  aminopeptidase N  40.9 
 
 
849 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.385207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1919  aminopeptidase N  41.22 
 
 
885 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.280956  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0957  aminopeptidase N  43.41 
 
 
878 aa  733    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1779  aminopeptidase N  41.11 
 
 
849 aa  670    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0345573 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4053  aminopeptidase N  41.31 
 
 
847 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339563  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3725  aminopeptidase N  44.99 
 
 
885 aa  756    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>