33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0568 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0568  putative transcriptional regulator protein  100 
 
 		 346 aa  713    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1490  hypothetical protein  63.13 
 
 		 348 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0815411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0087  transcriptional regulator  50.29 
 
 		 348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2910  transcriptional regulator  48.66 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4751  transcriptional regulator-like protein  47.77 
 
 		 345 aa  332  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0885788  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1199  putative transcriptional regulator protein  31.78 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4566  transcriptional regulator protein-like protein  25.2 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.439608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.02 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  24.76 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.23 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  25.26 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.18 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.45 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  23.08 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  24.07 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.71 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0570  hypothetical protein  26 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  21.7 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  22.62 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.57 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  22.34 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  21.83 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  21.31 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.11 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  24.18 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.93 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.19 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.43 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  21.7 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  22.81 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  24.34 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2768  hypothetical protein  42.86 
 
 		 57 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.945651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>