53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3295 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3295  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 
188 aa  383  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  31.79 
 
 
265 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  31.13 
 
 
265 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  31.13 
 
 
265 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  30.46 
 
 
265 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  29.8 
 
 
265 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  29.8 
 
 
265 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  29.8 
 
 
265 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  29.8 
 
 
265 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  29.8 
 
 
265 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  35.29 
 
 
282 aa  58.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  29.8 
 
 
265 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  32.32 
 
 
488 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  32.67 
 
 
208 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  27.38 
 
 
286 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  30.54 
 
 
163 aa  55.1  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  29.14 
 
 
229 aa  52.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  29.41 
 
 
247 aa  51.2  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  41.79 
 
 
304 aa  50.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  28.86 
 
 
239 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  27.78 
 
 
259 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  28.19 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  40.45 
 
 
546 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  29.75 
 
 
234 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  33.73 
 
 
197 aa  48.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28.83 
 
 
259 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28.83 
 
 
259 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  28.83 
 
 
259 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  28.83 
 
 
253 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  35.82 
 
 
277 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.07 
 
 
253 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  30.07 
 
 
253 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.07 
 
 
253 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.07 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.07 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  40 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  37.7 
 
 
242 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  42.37 
 
 
203 aa  45.1  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  26.71 
 
 
264 aa  45.1  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  28.67 
 
 
235 aa  44.7  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  26.42 
 
 
267 aa  44.7  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  37.33 
 
 
400 aa  44.7  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  38.36 
 
 
201 aa  44.7  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  23.4 
 
 
239 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  41.54 
 
 
253 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  27.21 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  33.85 
 
 
262 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  26.19 
 
 
270 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  42.37 
 
 
231 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  43.1 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  28.57 
 
 
231 aa  41.6  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  28.92 
 
 
185 aa  41.2  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  28.24 
 
 
200 aa  41.2  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>