30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3210 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  100 
 
 		 569 aa  1187    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  41.63 
 
 		 567 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  33.46 
 
 		 573 aa  289  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  32.89 
 
 		 556 aa  270  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  30.86 
 
 		 548 aa  247  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 558 aa  190  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2052  extracellular solute-binding protein family 1  29.69 
 
 		 565 aa  178  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  29.16 
 
 		 566 aa  177  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 531 aa  63.5  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 557 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 533 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.57 
 
 		 544 aa  58.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  23.3 
 
 		 551 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 		 541 aa  53.9  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 505 aa  52.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1188  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 587 aa  52  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  22.02 
 
 		 523 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 553 aa  52  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3570  hypothetical protein  30.48 
 
 		 566 aa  50.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 553 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.2 
 
 		 520 aa  50.4  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 		 501 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 		 558 aa  47  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 556 aa  46.2  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 552 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 585 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 522 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 525 aa  45.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2347  extracellular solute-binding protein  43.4 
 
 		 431 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 486 aa  43.5  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>