More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2529 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  100 
 
 		 185 aa  381  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  70.27 
 
 		 185 aa  280  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  68.65 
 
 		 185 aa  271  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  67.03 
 
 		 186 aa  271  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  60 
 
 		 185 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  58.92 
 
 		 185 aa  237  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  55.14 
 
 		 188 aa  233  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  57.3 
 
 		 185 aa  232  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  60 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  60 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  58.38 
 
 		 185 aa  224  8e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  53.51 
 
 		 185 aa  223  9e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  54.89 
 
 		 185 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  55.43 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  54.35 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  53.8 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  54.35 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  53.26 
 
 		 185 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  50.81 
 
 		 186 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  53.26 
 
 		 185 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  52.72 
 
 		 185 aa  210  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  52.17 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  52.17 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  52.17 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  52.17 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  52.17 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  52.17 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  52.17 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  53.26 
 
 		 185 aa  207  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  53.8 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  52.17 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  51.63 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  51.63 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  51.09 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  49.73 
 
 		 186 aa  198  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  50 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0468  translation elongation factor P  47.83 
 
 		 187 aa  197  7.999999999999999e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.019587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  48.92 
 
 		 187 aa  194  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0810  translation elongation factor P  49.46 
 
 		 185 aa  194  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  49.46 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  49.46 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  50.54 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  47.83 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  47.28 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0679  translation elongation factor P  49.46 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  45.9 
 
 		 189 aa  193  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0029  elongation factor P  50 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  47.57 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  47.57 
 
 		 187 aa  191  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  47.28 
 
 		 186 aa  190  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  48.37 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  48.65 
 
 		 187 aa  189  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  46.74 
 
 		 186 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  46.74 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  47.85 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  48.9 
 
 		 188 aa  188  5e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  45.95 
 
 		 186 aa  187  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  46.74 
 
 		 187 aa  187  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  48.91 
 
 		 187 aa  187  8e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  48.91 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  47.03 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  46.2 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  48.63 
 
 		 189 aa  184  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  47.8 
 
 		 187 aa  184  6e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  47.28 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  45.95 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  48.09 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2315  elongation factor P  46.74 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  45.65 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  47.03 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  45.65 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  45.95 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3072  translation elongation factor P  48.11 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  44.02 
 
 		 185 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  45.05 
 
 		 189 aa  180  8.000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  47.03 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  45.95 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  45.11 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  46.2 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  45.41 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  45.95 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  45.41 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  45.41 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  44.57 
 
 		 185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  45.65 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  45.6 
 
 		 188 aa  178  4e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  45.95 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  46.7 
 
 		 188 aa  178  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  46.7 
 
 		 188 aa  178  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  44.86 
 
 		 187 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  45.25 
 
 		 190 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  45.25 
 
 		 190 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0714  hypothetical protein  48.66 
 
 		 190 aa  177  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.469656 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  45.41 
 
 		 187 aa  177  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  46.74 
 
 		 188 aa  177  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  45.6 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  46.74 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  45.11 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>