117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2378 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2378  aluminium resistance family protein  100 
 
 		 434 aa  892    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00133186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0794  aluminium resistance protein  58.99 
 
 		 430 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0594  Aluminium resistance family protein  57.24 
 
 		 428 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000910019  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1362  aluminum resistance protein  57.21 
 
 		 426 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00883878  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1175  aluminum resistance protein  57.21 
 
 		 426 aa  478  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.446504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1618  aluminium resistance family protein  54.35 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0222221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2383  aluminium resistance family protein  53.19 
 
 		 423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.187803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1233  Aluminium resistance family protein  52.37 
 
 		 422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2115  Aluminium resistance family protein  55.44 
 
 		 423 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3733  hypothetical protein  53.43 
 
 		 423 aa  461  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3805  aluminum resistance protein  53.43 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1500  aluminum resistance protein  53.19 
 
 		 423 aa  461  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0198374 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3551  hypothetical protein  53.43 
 
 		 423 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3451  aluminum resistance protein  53.43 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3464  aluminum resistance protein  53.66 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3835  hypothetical protein  53.43 
 
 		 423 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3471  aluminium resistance family protein  53.19 
 
 		 423 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0016496  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3756  aluminum resistance protein  53.43 
 
 		 423 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00841285  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3715  aluminum resistance protein  53.66 
 
 		 423 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2242200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2133  Aluminium resistance family protein  56.66 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.821926  normal  0.0213182 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1879  aluminium resistance family protein  51.91 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000283572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0558  aluminium resistance family protein  51.88 
 
 		 433 aa  441  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1496  Aluminium resistance family protein  49.64 
 
 		 426 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000675206  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0874  hypothetical protein  49.76 
 
 		 412 aa  420  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1920  Aluminium resistance family protein  51.23 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1366  hypothetical protein  48.54 
 
 		 412 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1392  hypothetical protein  48.54 
 
 		 412 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3553  aluminum resistance family protein  49.88 
 
 		 409 aa  411  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.916774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2723  Aluminium resistance family protein  50.86 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.839574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4213  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  49.25 
 
 		 409 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.226781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0951  Aluminium resistance family protein  45.48 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1005  putative aluminum resistance protein  48.26 
 
 		 411 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000549762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0641  Aluminium resistance family protein  50 
 
 		 407 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3348  Aluminium resistance family protein  48.99 
 
 		 410 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0663  Aluminium resistance family protein  49.5 
 
 		 407 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21401  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  48.26 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4811  Aluminium resistance family protein  47.47 
 
 		 432 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.851244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1269  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  48.01 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1119  aluminium resistance  49.76 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.165119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2562  aluminum resistance protein-like  48.98 
 
 		 409 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1438  aluminium resistance  46.02 
 
 		 416 aa  383  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.406452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17971  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  47.02 
 
 		 433 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1503  Aluminium resistance family protein  48.16 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000404757 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1882  cystathionine beta-lyase family protein  44.2 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000688735 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2190  hypothetical protein  48.7 
 
 		 448 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2540  hypothetical protein  44.1 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28921  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  48.44 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1571  Aluminium resistance family protein  45.59 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18601  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  42.99 
 
 		 430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18601  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  40.65 
 
 		 430 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1762  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  42.48 
 
 		 430 aa  335  9e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18791  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  42.29 
 
 		 430 aa  332  8e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  29.44 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  28.43 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  28.9 
 
 		 398 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  28.9 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  26.94 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  27.14 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  27.14 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  27.14 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  28.9 
 
 		 398 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  29.25 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  28.9 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  26.22 
 
 		 394 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  27.5 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  30.15 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  26.47 
 
 		 392 aa  50.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  25.26 
 
 		 376 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  28.9 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1986  Cystathionine gamma-lyase  28.8 
 
 		 390 aa  50.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  23.93 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43850  Cystathionine gamma-synthase  29.31 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237057  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1805  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  33.81 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  29.26 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  27.34 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  26.4 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  27 
 
 		 393 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  27.84 
 
 		 373 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  28.93 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  28.16 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0357  hypothetical protein  27.42 
 
 		 364 aa  47.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  26.4 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  27.42 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.21 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0481  O-acetylhomoserineaminocarboxypropyltransferase  23.44 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4904  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  25.36 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.247924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  27.56 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_378  serine hydroxymethyltransferase  25.91 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  27.72 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  27.32 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  28.04 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  26.26 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  27.98 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0413  serine hydroxymethyltransferase  25.91 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.774669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  27.92 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1876  cystathionine gamma-synthase  28.05 
 
 		 341 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.562366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  26.26 
 
 		 398 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  28.42 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  25.83 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  31.3 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>