41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1554 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  615  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  40.45 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2859  helix-turn-helix domain-containing protein  24.82 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000554172  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000308908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1239  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  38.82 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  38.82 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1080  DNA-binding protein  36.78 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0425  transcriptional regulator  40.7 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.732449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1163  DNA-binding protein  36.78 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1013  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4288  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.492783  normal  0.641627 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1212  transcriptional regulator, XRE family  36.78 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.295347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1271  DNA-binding protein  36.78 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00018946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1058  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.758834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1061  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000113559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1315  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000145495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4129  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3869  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00219461  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 436 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  37.1 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  37.1 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  34.34 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  37.1 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  37.1 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  37.1 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  37.1 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1061  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 272 aa  46.6  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00012994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2474  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 267 aa  46.6  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  37.1 
 
 		 285 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  24.38 
 
 		 403 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1693  XRE family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0267924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  35.48 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  32.99 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 192 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 189 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  32.2 
 
 		 421 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  32.2 
 
 		 421 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>