116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1186 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1186  microcompartments protein  100 
 
 		 182 aa  362  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0360  microcompartments protein  46.93 
 
 		 181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1303  microcompartments protein  44.57 
 
 		 181 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0085  microcompartments protein  39.56 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4895  microcompartments protein  43.09 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2231  polyhedral body protein  35.71 
 
 		 184 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2277  polyhedral body protein  35.16 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0109336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2390  polyhedral body protein  35.16 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2177  polyhedral body protein  34.62 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2224  polyhedral body protein  34.62 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0143783  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1371  microcompartments protein  38.89 
 
 		 183 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3269  microcompartments protein  44.75 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.942262  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3265  putative propanediol utilization protein PduT  43.09 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1916  microcompartments protein  35.96 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2056  microcompartments protein  34.48 
 
 		 184 aa  124  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2295  propanediol utilization protein PduT  36.46 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1244  microcompartments protein  40.22 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1939  microcompartments protein  34.46 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0901  ethanolamine utilization protein  30.68 
 
 		 184 aa  97.8  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2636  microcompartments protein  28.96 
 
 		 185 aa  92  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3272  propanediol utilization protein (PduT)-like  34.12 
 
 		 182 aa  91.3  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5812  microcompartments protein  31.02 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.723553  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1366  microcompartments protein  31.61 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1608  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  32.26 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1355  microcompartments protein  31.18 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.431976  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1885  carboxysome shell peptide, CsoS1  34.09 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06101  carboxysome structural protein CsoS1  34.09 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.33467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1741  microcompartments protein  30.77 
 
 		 96 aa  50.8  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4472  microcompartments protein  32.99 
 
 		 102 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.518185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1865  microcompartments protein  32.99 
 
 		 102 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08071  carboxysome shell protein CsoS1  31.91 
 
 		 103 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1878  carboxysome shell protein CsoS1  32.95 
 
 		 103 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1615  carboxysome shell peptide, CsoS1  32.95 
 
 		 103 aa  48.9  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0557247  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0751  carboxysome shell peptide, CsoS1  32.95 
 
 		 103 aa  48.9  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0549  carboxysome shell protein CsoS1  32.95 
 
 		 103 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06051  carboxysome shell protein CsoS1  32.95 
 
 		 103 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0748449  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06031  carboxysome shell protein CsoS1  32.95 
 
 		 103 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.207245  normal  0.289857 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05751  carboxysome shell protein CsoS1  32.95 
 
 		 103 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05511  carboxysome shell protein CsoS1  32.95 
 
 		 103 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1372  microcompartments protein  34.29 
 
 		 103 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06131  carboxysome shell protein CsoS1  32.95 
 
 		 103 aa  48.5  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.172754  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2087  microcompartments protein  31.13 
 
 		 107 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0845  microcompartments protein  32.94 
 
 		 97 aa  47.8  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1981  carboxysome structural polypeptide  34.83 
 
 		 98 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4471  microcompartments protein  29.09 
 
 		 114 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0844  microcompartments protein  32.94 
 
 		 96 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.605496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0846  microcompartments protein  32.94 
 
 		 102 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.705966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3851  microcompartments protein  34.41 
 
 		 112 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.919315  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05581  hypothetical protein  34.12 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1181  microcompartments protein  31.33 
 
 		 100 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1597  microcompartments protein  32.65 
 
 		 111 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1373  microcompartments protein  31.73 
 
 		 103 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1618  microcompartments protein  31.63 
 
 		 102 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1864  microcompartments protein  29.73 
 
 		 114 aa  47.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1622  microcompartments protein  32.65 
 
 		 111 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.392894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4338  carboxysome structural polypeptide  34.88 
 
 		 99 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3852  microcompartments protein  29.81 
 
 		 103 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1742  microcompartments protein  33.75 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1371  microcompartments protein  32.65 
 
 		 112 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0210  microcompartments protein  32.58 
 
 		 100 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1596  microcompartments protein  30.77 
 
 		 103 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1621  microcompartments protein  30.77 
 
 		 103 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.540022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2644  carboxysome structural peptide CsoS1B  34.88 
 
 		 124 aa  45.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0758  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmK  30.68 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.531252  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1425  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmO  26.7 
 
 		 276 aa  45.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.125275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1749  microcompartments protein  29.89 
 
 		 93 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2158  microcompartments protein  29.7 
 
 		 101 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.714237 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3280  carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein-like  30.49 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08151  hypothetical protein  30.49 
 
 		 91 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2641  microcompartments protein  34.48 
 
 		 96 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0785  microcompartments protein  25.9 
 
 		 270 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0812  microcompartments protein  25.9 
 
 		 270 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1617  microcompartments protein  30.61 
 
 		 113 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0896  ethanolamine utilization protein EutM  34.48 
 
 		 96 aa  44.3  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1980  carboxysome structural peptide CsoS1B  33.72 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1421  putative carboxysome assembly protein  30.93 
 
 		 102 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00194265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4339  carboxysome structural peptide CsoS1B  33.72 
 
 		 115 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0916  microcompartments protein  34.88 
 
 		 98 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1382  microcompartments protein  34.48 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1684  carboxysome shell peptide  34.48 
 
 		 100 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0610381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2645  carboxysome shell protein CsoS1A  33.72 
 
 		 101 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2646  carboxysome shell protein, CsoS1C  33.72 
 
 		 99 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0894  ethanolamine utilization protein  39.34 
 
 		 254 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2647  major carboxysome shell protein 1C (carbon dioxide concentrating mechanism protein)  31.46 
 
 		 113 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2287  propanediol utilization protein PduK  33.72 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1383  microcompartments protein  33.33 
 
 		 98 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1683  carboxysome shell peptide  40.35 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373595  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1685  carboxysome shell peptide  33.33 
 
 		 98 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0523027  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0124  microcompartments protein  41.07 
 
 		 103 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0125  microcompartments protein  40.35 
 
 		 103 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0126  microcompartments protein  34.88 
 
 		 107 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0915  microcompartments protein  34.88 
 
 		 98 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1381  microcompartments protein  34.88 
 
 		 112 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1859  microcompartments protein  27.18 
 
 		 102 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2748  microcompartments protein  25.45 
 
 		 271 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4908  microcompartments protein  35.71 
 
 		 98 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1885  microcompartments protein  27.18 
 
 		 102 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 256 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0864  microcompartments protein  32.56 
 
 		 99 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.465845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5815  microcompartments protein  29.55 
 
 		 99 aa  42.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588526  normal  0.838674 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>