178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0313 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  100 
 
 		 126 aa  259  8e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  49.57 
 
 		 134 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  53.1 
 
 		 133 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  51.33 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  45.61 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  43.97 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  41.88 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  43.97 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  43.33 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  40.17 
 
 		 138 aa  96.7  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  39.47 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  41.18 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  40.18 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  37.07 
 
 		 134 aa  92  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  39.45 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  39.17 
 
 		 129 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  37.7 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  39.06 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  38.66 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  40.37 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  38.94 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  34.55 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  34.92 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  38.39 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  39.45 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  38.53 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  37.17 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0764  flagellar protein FliS  36.52 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  32.41 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  35.4 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  33.05 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  31.58 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  30.56 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  34.82 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  34.26 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3234  flagellar protein FliS  35.29 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  34.62 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  33.05 
 
 		 286 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3037  flagellar protein FliS  36.63 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  30.56 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  34.91 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  33.03 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  33.04 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  36.89 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  29.63 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  30.83 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  32.11 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  33.05 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  29.06 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  32.26 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  32.17 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  33.04 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  33.04 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  33.04 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  31.19 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  36.36 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  33.04 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  31.3 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  27.78 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  33.04 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  31.19 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  27.83 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  32.11 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  32.08 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  32.08 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  28.07 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  26.96 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  32.11 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  25.93 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  31.03 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  28.7 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  29.36 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  32.11 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  32.11 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2140  flagellar protein FliS  32.11 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0224  flagellar protein FliS  32.11 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  32.11 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3398  flagellar protein FliS  32.11 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  29.52 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1492  flagellar protein FliS  33.01 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  30.28 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  27.78 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  29.63 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  32.11 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  31.48 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  25 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  30.56 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  30.56 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  31.19 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  28.97 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  28.04 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3062  flagellar protein FliS  31.19 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>