23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2424 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  440  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  73.3 
 
 		 207 aa  315  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  50 
 
 		 217 aa  224  6e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  48.47 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  40.36 
 
 		 221 aa  174  8e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  40 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  45.2 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  41.51 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  40.53 
 
 		 225 aa  160  9e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  38.12 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  41.82 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  41.71 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  42.64 
 
 		 360 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  44.38 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  38.99 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  40.84 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  41.5 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  37.33 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  40.5 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  37.28 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  36.87 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  28.43 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  27.6 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>