32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0718 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  87.37 
 
 
396 aa  703    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  797    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  54.2 
 
 
395 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  44.81 
 
 
396 aa  311  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  42.13 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  40.61 
 
 
397 aa  276  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  75.28 
 
 
199 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  41.56 
 
 
391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  40.84 
 
 
400 aa  264  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  40.55 
 
 
407 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  36.78 
 
 
427 aa  256  6e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  38.11 
 
 
412 aa  242  7e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  37.65 
 
 
412 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  55.45 
 
 
204 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  32.71 
 
 
461 aa  177  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  30.15 
 
 
449 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  30.64 
 
 
457 aa  123  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  27.06 
 
 
368 aa  100  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  23.9 
 
 
412 aa  97.1  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  27.89 
 
 
353 aa  90.5  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  24.94 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  25 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  26.58 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  26.9 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  22.3 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2442  ATPase  26.13 
 
 
756 aa  53.9  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  20.49 
 
 
1868 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4896  hypothetical protein  23.7 
 
 
441 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.815839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0132  hypothetical protein  23.24 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  23.4 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1414  hypothetical protein  24.43 
 
 
148 aa  44.7  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0056  hypothetical protein  27.51 
 
 
660 aa  43.1  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00640513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>