More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1156 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  100 
 
 		 85 aa  172  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05760  putative 30S ribosomal protein S17  89.41 
 
 		 87 aa  160  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0388  30S ribosomal protein S17  90.48 
 
 		 86 aa  160  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  76.83 
 
 		 84 aa  129  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  69.41 
 
 		 85 aa  127  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  73.17 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  71.95 
 
 		 84 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  69.88 
 
 		 101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  68.29 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3658  ribosomal protein S17  68.24 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233058  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3153  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  67.47 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  65.85 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  63.53 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2912  30S ribosomal protein S17  64.71 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  64.29 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  60.71 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  65.43 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  59.52 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 84 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  64.63 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3896  SSU ribosomal protein S17P  62.65 
 
 		 93 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  60.71 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0571  30S ribosomal protein S17  59.52 
 
 		 96 aa  105  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1175  ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00103981  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  62.65 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1716  30S ribosomal protein S17  64.29 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3749  30S ribosomal protein S17  60.71 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5133  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.768581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  61.9 
 
 		 98 aa  103  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  67.12 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23380  SSU ribosomal protein S17P  63.41 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000933306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0295  ribosomal protein S17  60 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00205057  normal  0.0615063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  65.79 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  62.03 
 
 		 100 aa  100  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  62.65 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  59.52 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3426  30S ribosomal protein S17  59.52 
 
 		 94 aa  100  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2678  ribosomal protein S17  60.71 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  60.71 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  60 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  55.42 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  60.24 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04070  SSU ribosomal protein S17P  62.2 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4498  30S ribosomal protein S17  58.82 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  55.42 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20780  SSU ribosomal protein S17P  57.32 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3003  SSU ribosomal protein S17P  66.22 
 
 		 83 aa  98.6  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6556  hitchhiker  0.00610276 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0234  ribosomal protein S17  55.42 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  61.33 
 
 		 82 aa  97.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3914  30S ribosomal protein S17  60.98 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0243  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 80 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0240  30S ribosomal protein S17  62.16 
 
 		 80 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0332  30S ribosomal protein S17  56.25 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000351608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  57.32 
 
 		 86 aa  97.1  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01260  ribosomal protein S17  61.45 
 
 		 86 aa  97.1  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.693466  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  62.34 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23720  SSU ribosomal protein S17P  59.04 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0423022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  55.42 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  57.32 
 
 		 99 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  57.32 
 
 		 99 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1942  30S ribosomal protein S17  59.52 
 
 		 85 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2169  ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 86 aa  97.1  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.277733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1937  30S ribosomal protein S17  59.52 
 
 		 85 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2027  30S ribosomal protein S17  59.52 
 
 		 85 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610607  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  57.32 
 
 		 99 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0258  30S ribosomal protein S17  55.42 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000603244  hitchhiker  0.00894491 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0591  30S ribosomal protein S17  54.88 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 82 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4306  30S ribosomal protein S17  59.76 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174188  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  58.33 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  57.5 
 
 		 84 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  60.26 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  95.9  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2568  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 83 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  63.01 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0700  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000459062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  58.54 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  54.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  61.64 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>