More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1107 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1107  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 330 aa  673    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4074  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.545411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  29.74 
 
 		 430 aa  90.1  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  31.32 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1250  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  28.4 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157678  hitchhiker  0.000000000000131869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3042  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  28.4 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0447  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.429575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 443 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3184  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.262966  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  30.12 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1310  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.731702  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1327  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1346  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  30.12 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  22.49 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3826  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107341  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0179  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.203748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  28.51 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.78 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.3 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  26.3 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 428 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.94 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 371 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 400 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.31 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.91 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  23.7 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.94 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.94 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.94 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 417 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.55 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  26.44 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  26.4 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  24.07 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  37.39 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 		 1261 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2280  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00320483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.08 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7046  putative glycosyltransferase  30.04 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.378884  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>