23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0460 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  56.35 
 
 		 223 aa  224  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  56.83 
 
 		 212 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  53.06 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  41.67 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  44.5 
 
 		 232 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  44.29 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  47.4 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  47.85 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  41.82 
 
 		 202 aa  169  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  44.92 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  39.46 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  45.18 
 
 		 360 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  47.85 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  39.24 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  43.55 
 
 		 223 aa  151  8.999999999999999e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  40.26 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  43.23 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  41.46 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  41.79 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  39.57 
 
 		 250 aa  121  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  30.84 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  28.37 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>