More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0289 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
378 aa  786    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  57.14 
 
 
382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
389 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
384 aa  206  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
371 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
408 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
361 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
386 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
387 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
387 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  35.32 
 
 
374 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
374 aa  155  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
376 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  33.23 
 
 
430 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
400 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
382 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 
370 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  30.62 
 
 
364 aa  146  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
378 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
437 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
393 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  37.18 
 
 
366 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
370 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 
355 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
381 aa  143  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 
361 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 
377 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  31.25 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
435 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
360 aa  138  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
386 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 
1229 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
394 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
366 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
434 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
384 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.95 
 
 
375 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  31.01 
 
 
380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  32.71 
 
 
346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
431 aa  135  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
1028 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.68 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 
1089 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
435 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
420 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  33.46 
 
 
360 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
374 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  29.45 
 
 
381 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 
381 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
393 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 
340 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
371 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 
380 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
364 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  31.44 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
1261 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
380 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
442 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  31.23 
 
 
375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
464 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
2490 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  30.86 
 
 
375 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
428 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
364 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
385 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
382 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
364 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
377 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
397 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
380 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
395 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  30.12 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  31.02 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  30.12 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>