48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2880 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2880  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
137 aa  280  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248233  normal  0.229872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3695  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.11 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3890  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.45 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  40.3 
 
 
232 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3696  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.65 
 
 
165 aa  50.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.02 
 
 
356 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.76 
 
 
1089 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  45.76 
 
 
229 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.68 
 
 
280 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  44.64 
 
 
204 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.02 
 
 
306 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.51 
 
 
201 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  32.99 
 
 
241 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  42 
 
 
249 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.89 
 
 
306 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.07 
 
 
319 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  31.52 
 
 
228 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.1 
 
 
412 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0048  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlA  37.68 
 
 
364 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0248425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  42 
 
 
285 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.98 
 
 
260 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.76 
 
 
395 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.92 
 
 
234 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  40 
 
 
292 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.38 
 
 
372 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.38 
 
 
322 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.81 
 
 
635 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.76 
 
 
395 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  34.43 
 
 
224 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38 
 
 
332 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.38 
 
 
360 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.68 
 
 
317 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
300 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.44 
 
 
283 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2786  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.29 
 
 
587 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  37.29 
 
 
406 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  30.88 
 
 
239 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  37.68 
 
 
462 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.76 
 
 
398 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.76 
 
 
398 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.66 
 
 
323 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.76 
 
 
398 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  37.1 
 
 
234 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.25 
 
 
283 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.59 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.93 
 
 
447 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.31 
 
 
198 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.82 
 
 
160 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>