81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08470 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_08470  4Fe-4S protein  100 
 
 
372 aa  762    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.576639  normal  0.359162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1301  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.73 
 
 
375 aa  342  4e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09830  2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  42.05 
 
 
356 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207702 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24 
 
 
461 aa  88.6  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.906646 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07910  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  23.66 
 
 
447 aa  69.3  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1183  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.97 
 
 
363 aa  62.8  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22710  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  25.07 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.941505 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06190  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  25.21 
 
 
401 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.348561  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1493  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.27 
 
 
369 aa  57  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0352  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.51 
 
 
392 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0028801  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16940  4Fe-4S protein  23.82 
 
 
450 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27430  4Fe-4S protein  26.23 
 
 
414 aa  53.9  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1914  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  41.89 
 
 
228 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0781471  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3026  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.97 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.19 
 
 
371 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0622  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.05 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.421879  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.63 
 
 
421 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0495  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.41 
 
 
394 aa  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.09 
 
 
383 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000152495  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0388  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.4 
 
 
334 aa  49.7  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0236  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.55 
 
 
553 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.36 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2063  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000008917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.09 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.28 
 
 
553 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4133  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.28 
 
 
553 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.504849  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.46 
 
 
656 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.9 
 
 
427 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2610  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.66 
 
 
377 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.863 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  26.32 
 
 
136 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4424  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.08 
 
 
563 aa  47  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.28 
 
 
553 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0130862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2443  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.9 
 
 
452 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.915566 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0937  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44 
 
 
158 aa  47  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.153792  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0850  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.83 
 
 
660 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1834  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.72 
 
 
146 aa  46.6  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0162171  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  29.76 
 
 
135 aa  46.2  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.89 
 
 
553 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3788  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.89 
 
 
553 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.904196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4506  iron-sulfur cluster-binding protein  23.06 
 
 
558 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.89 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1173  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
990 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.461948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2511  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  36.84 
 
 
672 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1209  heterodisulfide reductase, A subunit  38.03 
 
 
660 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06170  4Fe-4S protein  36.11 
 
 
226 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0331  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  39.06 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2694  ferredoxin  32.88 
 
 
287 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00378888 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22790  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  34.62 
 
 
219 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  33.33 
 
 
601 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0654  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  32.43 
 
 
654 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.558651  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3988  hypothetical protein  39.39 
 
 
160 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0935811  normal  0.360541 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  40.91 
 
 
600 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.67 
 
 
307 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.360841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0056  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.28 
 
 
558 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2281  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  20.6 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000264067  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.13 
 
 
132 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.29 
 
 
266 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  33.71 
 
 
592 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.85 
 
 
213 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0482  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.65 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.07 
 
 
392 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000930886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.99 
 
 
1006 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.378753  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3013  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.99 
 
 
1006 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.672431  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0217  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.86 
 
 
428 aa  43.9  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.531455  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 
211 aa  43.5  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1804  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.76 
 
 
1009 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.769121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 
238 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  36.07 
 
 
588 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0014  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.62 
 
 
1116 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.952368 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2126  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  28.57 
 
 
756 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0342  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.4 
 
 
995 aa  43.5  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.573197  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.63 
 
 
429 aa  43.1  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1112  heterodisulfide reductase, iron-sulfur-binding subunit, putative  29.67 
 
 
756 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0184173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.08 
 
 
432 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  32 
 
 
488 aa  42.7  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06210  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  23.92 
 
 
425 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0140  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  34.25 
 
 
867 aa  42.7  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.0838e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.85 
 
 
1126 aa  42.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1627  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
201 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0067  Fe-S cluster domain-containing protein  50 
 
 
293 aa  42.7  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.730786  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2019  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.57 
 
 
57 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>