95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1914 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1914  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  100 
 
 		 228 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0781471  normal  0.276703 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0885  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  46.22 
 
 		 267 aa  190  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0213138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2390  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin) alpha and beta subunits-like  43.46 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000111443  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1278  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.24 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000199132  normal  0.43012 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1379  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.41 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.860949  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0748  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  32 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0697  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 196 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2218  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S subunit  31.58 
 
 		 289 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1139  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.9 
 
 		 288 aa  88.6  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.079984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1551  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.28 
 
 		 289 aa  85.9  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1973  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.56 
 
 		 291 aa  85.5  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3941  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.24 
 
 		 315 aa  85.1  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000105876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2242  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  31.28 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1978  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  29.24 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.996407  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1475  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.73 
 
 		 301 aa  82  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0347931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2763  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.16 
 
 		 198 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2618  sulfite reductase, beta subunit  26.62 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.433957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1969  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.27 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000637611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0247  hypothetical protein  28.48 
 
 		 307 aa  78.2  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1351  iron-sulfur cluster-binding protein  29.34 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1781  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.1 
 
 		 317 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1570  Iron-sulfur cluster-binding protein  27.84 
 
 		 320 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0018133  normal  0.554511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4107  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.76 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.975487  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0732  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.33 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344007  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0206  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.98 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2423  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.67 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755414  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0557  sulfite reductase, subunit C  33.33 
 
 		 322 aa  72  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1425  anaerobic sulfite reductase, subunit C  25.9 
 
 		 326 aa  72  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1691  anaerobic sulfite reductase, subunit C  26.45 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0354563  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0870  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  27.08 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  27.27 
 
 		 639 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1562  sulfite reductase, beta subunit  29.58 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1188  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.16 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1168  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.73 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00249386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1876  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.62 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2541  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.49 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000365571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0778  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.33 
 
 		 618 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.542223  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1603  sulfite reductase, subunit C  25.17 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1825  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.26 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2791  sulfite reductase subunit C  25.93 
 
 		 337 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2705  sulfite reductase, subunit C  25.93 
 
 		 337 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2925  sulfite reductase, subunit C  25.93 
 
 		 337 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2750  sulfite reductase subunit C  25.93 
 
 		 337 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2812  sulfite reductase subunit C  25.93 
 
 		 337 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1787  anaerobic sulfite reductase, C subunit  28.67 
 
 		 348 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2631  Ferredoxin hydrogenase  32.47 
 
 		 490 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000219307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0643  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.87 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.229691  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1955  ferredoxin  31.15 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.356544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0477  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.98 
 
 		 435 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00748244  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0285  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  36.62 
 
 		 340 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0862622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02090  hydrogenase large subunit domain protein  24.67 
 
 		 491 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1487  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.87 
 
 		 324 aa  45.4  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00133534  hitchhiker  0.0000000109439 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08470  4Fe-4S protein  41.89 
 
 		 372 aa  45.4  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.576639  normal  0.359162 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  32.79 
 
 		 493 aa  45.4  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0524  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 368 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 696 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2063  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 385 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000008917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1627  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.21 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0413  hydrogenase large subunit  27.78 
 
 		 485 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0146308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3677  radical SAM domain-containing protein  39.34 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.005025 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  34.48 
 
 		 478 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0634  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.66 
 
 		 354 aa  43.9  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.69 
 
 		 427 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0527  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  24.85 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2511  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.78 
 
 		 672 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3619  Radical SAM domain protein  37.7 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0347  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.9 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3465  hydrogenase large subunit domain protein  28.41 
 
 		 488 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1288  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit F  35.14 
 
 		 346 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04221  hypothetical protein  37.7 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2968  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.18 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0287  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.45 
 
 		 337 aa  43.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4614  radical SAM domain-containing protein  37.7 
 
 		 287 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04255  predicted pyruvate formate lyase activating enzyme  37.7 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4624  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  29.76 
 
 		 837 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_635  [Fe] hydrogenase, HymB subunit  32.81 
 
 		 626 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0725  hydrogenase-like  30.49 
 
 		 483 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000665726  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2294  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  25.44 
 
 		 381 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0531  hypothetical protein  32.39 
 
 		 367 aa  43.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0559  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.41 
 
 		 352 aa  43.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0920  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  25.44 
 
 		 381 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1166  putative iron-sulfur binding protein  32.94 
 
 		 707 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421061  normal  0.487764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2694  ferredoxin  35.21 
 
 		 287 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2281  ferredoxin hydrogenase  30.43 
 
 		 439 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 356 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0491  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 352 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0372  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.53 
 
 		 418 aa  42.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 429 aa  42  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1139  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  30.88 
 
 		 102 aa  42.4  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2531  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  24.26 
 
 		 381 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.576489  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 133 aa  42  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.356069  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0908  sulfite reductase, dissimilatory-type beta subunit  23.44 
 
 		 377 aa  42  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.88 
 
 		 924 aa  41.6  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0761  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.35 
 
 		 368 aa  41.6  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  24.77 
 
 		 400 aa  41.6  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>