222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2663 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2663  periplasmic binding protein  100 
 
 
340 aa  689    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2916  periplasmic binding protein  78.53 
 
 
337 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.421383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5234  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  69.41 
 
 
338 aa  508  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5226  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  70 
 
 
337 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4795  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  68.82 
 
 
337 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000034871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5247  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  70 
 
 
337 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4953  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  69.71 
 
 
337 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00660828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4815  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  68.53 
 
 
337 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000198288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5197  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  68.53 
 
 
337 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5330  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  69.85 
 
 
333 aa  497  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00008609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4918  periplasmic binding protein  69.41 
 
 
337 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000189068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0007  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  69.41 
 
 
339 aa  490  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0634  periplasmic binding protein  54.7 
 
 
353 aa  397  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000010772  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30540  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  46.32 
 
 
335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3702  periplasmic binding protein  43.86 
 
 
329 aa  273  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25350  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  40.71 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16600  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  46.1 
 
 
354 aa  257  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04580  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  42.23 
 
 
334 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.398248  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2663  periplasmic binding protein  34.21 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  28.36 
 
 
316 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  27.76 
 
 
316 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0760  periplasmic binding protein  30.3 
 
 
342 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0777  periplasmic binding protein  30.3 
 
 
342 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2404  periplasmic binding protein  31.46 
 
 
315 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0899785  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  30.3 
 
 
317 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  30.3 
 
 
317 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  30.3 
 
 
317 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  28.78 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2366  periplasmic binding protein  31.47 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.10704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
316 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0661  periplasmic binding protein  29.77 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  31.73 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0021  periplasmic binding protein  28.39 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1005  periplasmic binding protein  28.84 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3787  periplasmic binding protein  30.71 
 
 
314 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1111  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  28.08 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0403  transferrin receptor  30.53 
 
 
347 aa  109  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.400692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0675  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  30 
 
 
315 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1907  periplasmic binding protein  25.93 
 
 
350 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.217732  normal  0.206334 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1393  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
340 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3797  periplasmic binding protein  31.85 
 
 
309 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1007  iron-compound ABC transporter, iron-compound-binding protein  31.03 
 
 
342 aa  103  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00224248  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4264  transport system permease protein  29.41 
 
 
293 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34400  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  28.43 
 
 
302 aa  99.8  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1928  periplasmic binding protein  31.67 
 
 
307 aa  99.4  9e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  27.71 
 
 
339 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3340  periplasmic binding protein  28.03 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.002385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0300  periplasmic binding protein  28.95 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2591  ferric siderophore ABC transporter, periplasmic siderophore-binding protein  28.28 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619611  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2627  periplasmic binding protein  27.95 
 
 
301 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3666  periplasmic binding protein  27.62 
 
 
333 aa  94  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4396  periplasmic binding protein  25.76 
 
 
325 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3079  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.14 
 
 
312 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.42 
 
 
348 aa  92  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  24.85 
 
 
327 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3806  periplasmic binding protein  28.15 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.17678 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1626  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
322 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0949  transferrin receptor  24.92 
 
 
336 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0298481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.3 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.3 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  26.24 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.7 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.4 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1354  enterochelin ABC transporter, periplasmic enterochelin-binding protein, authentic frameshift  22.32 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.81 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.48 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.48 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.16 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  23.84 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  26.57 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  24.63 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0734  periplasmic binding protein  28.24 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.38 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.16 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000332  ferric vibriobactin enterobactin transport system substrate-binding protein VctP  24.05 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000938047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  24.38 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  24.38 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.38 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  24.38 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  24.38 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  23.71 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  28.09 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  24.06 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4488  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.46 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  23.87 
 
 
322 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  23.55 
 
 
330 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  23.55 
 
 
330 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4450  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.08 
 
 
315 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1770  periplasmic binding protein  24.89 
 
 
288 aa  62.8  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4265  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.39 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4102  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.39 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  26.34 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  28.85 
 
 
370 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4597  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.39 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  23.12 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4449  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.39 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4502  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.77 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  23.76 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  23.03 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0151  ferrichrome-binding periplasmic protein  29.8 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>