More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1486 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1486  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
551 aa  1114    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  49.36 
 
 
551 aa  559  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  36.48 
 
 
535 aa  316  8e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2260  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.51 
 
 
559 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0489  peptidoglycan glycosyltransferase  32.7 
 
 
568 aa  274  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000313702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0902  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 
566 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  31.11 
 
 
713 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  31.96 
 
 
708 aa  237  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0919  peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 
553 aa  232  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0272604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  30.3 
 
 
695 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.25 
 
 
643 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.15 
 
 
647 aa  230  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  29.38 
 
 
639 aa  228  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 
704 aa  227  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 
645 aa  226  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.59 
 
 
549 aa  226  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  29.63 
 
 
740 aa  221  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.53 
 
 
574 aa  219  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  28.5 
 
 
640 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  30.7 
 
 
719 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 
642 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  28.69 
 
 
610 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  29.34 
 
 
646 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  29.62 
 
 
636 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  30.45 
 
 
638 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  28.67 
 
 
678 aa  211  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  29.69 
 
 
644 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  28.57 
 
 
646 aa  208  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  27.74 
 
 
662 aa  206  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  27.24 
 
 
664 aa  203  8e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  29.34 
 
 
638 aa  202  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  29.58 
 
 
638 aa  202  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  28.57 
 
 
629 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  29.41 
 
 
638 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  28.81 
 
 
629 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  29.41 
 
 
638 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  29.41 
 
 
638 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  29.41 
 
 
638 aa  201  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  29.41 
 
 
638 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  28.81 
 
 
629 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  26.83 
 
 
646 aa  200  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  29.41 
 
 
638 aa  200  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 
636 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  29.59 
 
 
705 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  29.24 
 
 
638 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  29.41 
 
 
638 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  28.47 
 
 
629 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  29.29 
 
 
643 aa  197  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  28.27 
 
 
610 aa  196  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  25.71 
 
 
634 aa  196  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  28.88 
 
 
708 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  29.97 
 
 
600 aa  195  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  27.7 
 
 
631 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  28.4 
 
 
647 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  29.63 
 
 
619 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  26.37 
 
 
645 aa  190  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  28.13 
 
 
631 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  28.19 
 
 
586 aa  189  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.7 
 
 
618 aa  188  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  28.7 
 
 
711 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  27.47 
 
 
640 aa  187  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  29.56 
 
 
618 aa  187  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  29.56 
 
 
618 aa  187  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  27.96 
 
 
631 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  29.39 
 
 
618 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  26.15 
 
 
611 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  29.34 
 
 
618 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  29.39 
 
 
618 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  29.47 
 
 
728 aa  183  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  27.32 
 
 
628 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  27.68 
 
 
619 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  28.69 
 
 
641 aa  182  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  28.4 
 
 
609 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  28.85 
 
 
682 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  27.57 
 
 
646 aa  180  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  27.21 
 
 
663 aa  180  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.81 
 
 
582 aa  179  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 
553 aa  179  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  26.18 
 
 
615 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  27.86 
 
 
645 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  28.96 
 
 
721 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  27.33 
 
 
681 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  28.1 
 
 
618 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  28.1 
 
 
618 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  28.1 
 
 
618 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  25.94 
 
 
673 aa  178  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  28.1 
 
 
618 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  27.52 
 
 
612 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  27.52 
 
 
612 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  33.9 
 
 
473 aa  177  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  28.22 
 
 
681 aa  177  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  26.87 
 
 
648 aa  177  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  26.5 
 
 
610 aa  176  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  27.8 
 
 
627 aa  176  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  25.46 
 
 
650 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  27.47 
 
 
771 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  26.5 
 
 
598 aa  175  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  28.12 
 
 
610 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.44 
 
 
458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1175  peptidoglycan glycosyltransferase  29.02 
 
 
533 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>