45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5406 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5406  yecA family protein  100 
 
 
192 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0555  IS66 family orf4  44.51 
 
 
201 aa  171  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0521  IS66 family element, orf4  43.96 
 
 
201 aa  169  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  35.78 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4329  yecA family protein  32.23 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1225  yecA family protein  31.93 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00521886  normal  0.0870592 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6363  yecA family protein  31.93 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6093  yecA family protein  31.93 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5511  yecA family protein  31.93 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0098  YgfB and YecA  30.37 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2745  yecA family protein  27.37 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  26.32 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  27.27 
 
 
201 aa  63.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  31.25 
 
 
239 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  25.28 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  28.23 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0950  yecA family protein  29.79 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  32.26 
 
 
228 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  26.35 
 
 
232 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  26.35 
 
 
232 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  31.03 
 
 
237 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  31.03 
 
 
267 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  27.71 
 
 
204 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  26.32 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  23.95 
 
 
236 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  25.55 
 
 
235 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  27.2 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  27.47 
 
 
221 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  29.37 
 
 
259 aa  45.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4361  hypothetical protein  26.17 
 
 
134 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0666994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  29.47 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  27.47 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  27.47 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  27.47 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  27.39 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1179  yecA family protein  21.95 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100279  normal  0.0734438 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  24.07 
 
 
336 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  24.07 
 
 
336 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0617  yecA family protein  30.16 
 
 
264 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.038655  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1195  yecA family protein  23.2 
 
 
183 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  25.67 
 
 
221 aa  41.2  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  25.67 
 
 
221 aa  41.2  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  25.67 
 
 
221 aa  41.2  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  25.67 
 
 
221 aa  41.2  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  25.67 
 
 
221 aa  41.2  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>