40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5211 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 
419 aa  831    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  31.25 
 
 
706 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  29.69 
 
 
735 aa  133  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  29.97 
 
 
749 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  24.07 
 
 
728 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  24.87 
 
 
736 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  26.36 
 
 
315 aa  119  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  26.92 
 
 
715 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  25.64 
 
 
758 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  27.21 
 
 
884 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  24.56 
 
 
862 aa  92.8  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  22.34 
 
 
945 aa  89.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2072  KAP P-loop  27.97 
 
 
997 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.285295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  24.23 
 
 
706 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  28.06 
 
 
784 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1936  hypothetical protein  27.21 
 
 
978 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000106944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  21.67 
 
 
976 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  28.23 
 
 
577 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  27.66 
 
 
594 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  26.35 
 
 
591 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  26.09 
 
 
644 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  24.25 
 
 
650 aa  59.7  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  26.02 
 
 
647 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  26.02 
 
 
564 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  25.76 
 
 
623 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  26.79 
 
 
622 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  19.7 
 
 
672 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  26.39 
 
 
615 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  26.62 
 
 
628 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  26.62 
 
 
628 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  26.62 
 
 
628 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  28.67 
 
 
1065 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  21.19 
 
 
601 aa  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  26.27 
 
 
509 aa  46.6  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0710  hypothetical protein  25 
 
 
475 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  24.3 
 
 
671 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  22.48 
 
 
1093 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  20.5 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  28.1 
 
 
787 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  25.77 
 
 
611 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>