More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4688 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4688  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
539 aa  1080    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  51.75 
 
 
549 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  50.78 
 
 
549 aa  502  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  50.78 
 
 
549 aa  501  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  48.86 
 
 
547 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1859  Glucose-6-phosphate isomerase  49.72 
 
 
549 aa  496  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  47.39 
 
 
548 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  46.9 
 
 
547 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  43.23 
 
 
539 aa  479  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  46.73 
 
 
550 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  45.19 
 
 
549 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  47.85 
 
 
539 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  48.58 
 
 
541 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  48.83 
 
 
545 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  45.34 
 
 
549 aa  476  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  45.59 
 
 
559 aa  478  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  47.85 
 
 
539 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  46.34 
 
 
549 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  48.51 
 
 
547 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  47.17 
 
 
541 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  45.69 
 
 
548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  47.63 
 
 
541 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  47.07 
 
 
649 aa  471  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  44.78 
 
 
548 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  48.61 
 
 
545 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  44.78 
 
 
548 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  49.54 
 
 
541 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  43.18 
 
 
567 aa  465  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3385  glucose-6-phosphate isomerase  47.53 
 
 
545 aa  467  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  44.78 
 
 
548 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  46.73 
 
 
543 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  44.86 
 
 
550 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  48.35 
 
 
541 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  47.29 
 
 
543 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  46.73 
 
 
548 aa  464  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  47.2 
 
 
547 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  44.3 
 
 
550 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  45.58 
 
 
531 aa  463  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  44.78 
 
 
550 aa  463  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  42.18 
 
 
547 aa  461  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  43.87 
 
 
548 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  44.3 
 
 
550 aa  461  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7561  glucose-6-phosphate isomerase  47.57 
 
 
545 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  45.51 
 
 
562 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  41.68 
 
 
547 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  44.13 
 
 
552 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  44.84 
 
 
547 aa  458  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  43.93 
 
 
550 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  44.88 
 
 
547 aa  457  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  45.45 
 
 
548 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  48.33 
 
 
546 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  44.85 
 
 
552 aa  456  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  47.86 
 
 
546 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0378  glucose-6-phosphate isomerase  45.45 
 
 
536 aa  458  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419467  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  47.22 
 
 
556 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  44.22 
 
 
549 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2030  Glucose-6-phosphate isomerase  47.87 
 
 
550 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  47.22 
 
 
556 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  47.04 
 
 
540 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  45.68 
 
 
560 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  47.77 
 
 
550 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  43.28 
 
 
549 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  44.51 
 
 
548 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1950  glucose-6-phosphate isomerase  48.02 
 
 
533 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.0244382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  43.66 
 
 
549 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  43.76 
 
 
549 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1682  glucose-6-phosphate isomerase  47.01 
 
 
534 aa  450  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419793  normal  0.180807 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1394  glucose-6-phosphate isomerase  46.63 
 
 
533 aa  452  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  43.76 
 
 
549 aa  451  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2736  glucose-6-phosphate isomerase  47.19 
 
 
533 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  46.3 
 
 
556 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  45.15 
 
 
550 aa  452  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  43.58 
 
 
549 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  44.22 
 
 
549 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  46.67 
 
 
540 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  46.67 
 
 
556 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  45.15 
 
 
541 aa  450  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  43.76 
 
 
549 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  43.76 
 
 
549 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0307  glucose-6-phosphate isomerase  43.09 
 
 
549 aa  450  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  43.76 
 
 
549 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  43.58 
 
 
549 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  43.76 
 
 
549 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  43.76 
 
 
549 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  43.76 
 
 
549 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  43.58 
 
 
549 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  43.76 
 
 
549 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10963  glucose-6-phosphate isomerase  45.47 
 
 
553 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246514 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  43.76 
 
 
549 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7286  glucose-6-phosphate isomerase  48.75 
 
 
570 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813116  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  41.28 
 
 
545 aa  448  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  43.76 
 
 
549 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  44.13 
 
 
550 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  43.58 
 
 
549 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  45.12 
 
 
548 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  43.84 
 
 
545 aa  443  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1971  glucose-6-phosphate isomerase  45.51 
 
 
537 aa  443  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.799071  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  44.96 
 
 
551 aa  445  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  46.85 
 
 
542 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  44.08 
 
 
554 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>