289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4576 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  100 
 
 
323 aa  651    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  49.85 
 
 
319 aa  285  7e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
310 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  43.22 
 
 
310 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  41.54 
 
 
312 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  50.63 
 
 
305 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 
339 aa  221  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  48.96 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  42.12 
 
 
317 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  42.12 
 
 
317 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  41.05 
 
 
315 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
319 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  48.52 
 
 
315 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
306 aa  209  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  37.85 
 
 
325 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
342 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
317 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 
303 aa  205  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  40.06 
 
 
321 aa  202  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  46.78 
 
 
319 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  46.35 
 
 
319 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  41.96 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  51.11 
 
 
319 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  40.56 
 
 
307 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  39.7 
 
 
318 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  48.9 
 
 
289 aa  189  8e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  49.25 
 
 
382 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
327 aa  186  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  37.07 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0036  MutT/nudix family protein  39.43 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3316  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
319 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0036  MutT/nudix family protein  38.49 
 
 
315 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  33.44 
 
 
348 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 
341 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  47.25 
 
 
321 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  43.05 
 
 
314 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
314 aa  168  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 
301 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 
305 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  34.37 
 
 
331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  35.87 
 
 
303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  41.87 
 
 
321 aa  165  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  38.46 
 
 
303 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  45.08 
 
 
326 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  36.86 
 
 
308 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  37.05 
 
 
343 aa  156  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  44.81 
 
 
329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  34.05 
 
 
307 aa  152  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4126  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
318 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08204  NADH pyrophosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03360)  30.1 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0812746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  39.9 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
315 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  38.17 
 
 
331 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2476  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 
352 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
286 aa  143  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01890  NAD+ diphosphatase, putative  41.97 
 
 
474 aa  142  7e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
319 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  36.32 
 
 
261 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2754  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 
358 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  34.5 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  42.11 
 
 
330 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  41.92 
 
 
326 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8362  NAD(+) diphosphatase  37.5 
 
 
325 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  31.14 
 
 
260 aa  136  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  32.76 
 
 
289 aa  135  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1176  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.08579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3745  NUDIX hydrolase  33.84 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.963277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3498  NAD(+) diphosphatase  39.35 
 
 
310 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158806  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  38.22 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  35.77 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  36.44 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  37.25 
 
 
313 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  37.22 
 
 
265 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  39.11 
 
 
298 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  44.52 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1407  NADH pyrophosphatase  34.69 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1461  NADH pyrophosphatase  34.69 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086002  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1425  NADH pyrophosphatase  34.69 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19160  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  40.59 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0784  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 
392 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  36.81 
 
 
257 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  36.81 
 
 
257 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 
257 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  36.81 
 
 
257 aa  126  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  36.81 
 
 
257 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3810  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 
316 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158212 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  36.81 
 
 
257 aa  126  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  36.81 
 
 
257 aa  126  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
314 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  36.81 
 
 
257 aa  126  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  38.32 
 
 
257 aa  125  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  32.91 
 
 
258 aa  125  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 
291 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>