39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2071 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.75 
 
 		 998 aa  749    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2072  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  63.26 
 
 		 1003 aa  1295    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.437854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2071  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 		 1003 aa  2045    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00550  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 		 1380 aa  82.8  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487463 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00779  exo-beta-1,3-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11980)  22.25 
 
 		 781 aa  74.7  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913287  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08480  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 		 1380 aa  70.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  20.93 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  21.61 
 
 		 306 aa  60.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  24.83 
 
 		 281 aa  57  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.24 
 
 		 302 aa  54.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  29.01 
 
 		 334 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  22.61 
 
 		 350 aa  53.5  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  19.39 
 
 		 307 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  32.76 
 
 		 316 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  22.41 
 
 		 287 aa  51.2  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  31.2 
 
 		 313 aa  50.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  23.15 
 
 		 304 aa  51.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04825  conserved hypothetical protein  24.13 
 
 		 900 aa  50.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  31.62 
 
 		 533 aa  50.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  31.45 
 
 		 312 aa  48.9  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.69 
 
 		 301 aa  49.3  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.69 
 
 		 301 aa  49.3  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  26.02 
 
 		 352 aa  48.9  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28 
 
 		 334 aa  48.9  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.46 
 
 		 197 aa  48.5  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2638  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.01 
 
 		 556 aa  48.5  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  normal  0.259546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3991  hypothetical protein  30.72 
 
 		 635 aa  48.5  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  30.77 
 
 		 322 aa  47.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  36.71 
 
 		 308 aa  46.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1560  Parallel beta-helix repeat protein  26.26 
 
 		 832 aa  46.2  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.672453 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  33.33 
 
 		 308 aa  46.2  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.07 
 
 		 407 aa  46.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  35.96 
 
 		 357 aa  45.8  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0432  hypothetical protein  51.11 
 
 		 495 aa  45.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0833  hypothetical protein  41.67 
 
 		 451 aa  45.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000168293  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  25.74 
 
 		 296 aa  44.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3444  hypothetical protein  40.54 
 
 		 622 aa  44.7  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.623137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  48.78 
 
 		 368 aa  44.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.51 
 
 		 310 aa  44.7  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>