More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0661 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0661  response regulator receiver protein  100 
 
 		 264 aa  530  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 183 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  33.99 
 
 		 181 aa  85.9  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  32.91 
 
 		 181 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  33.11 
 
 		 181 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 181 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  31.41 
 
 		 168 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  32.28 
 
 		 181 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  31.68 
 
 		 182 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5178  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  33.09 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.075348  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  30.19 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  32 
 
 		 173 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0286  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0423  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0734879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  31.17 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  31.09 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  29.41 
 
 		 124 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2163  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2074  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  30.25 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3413  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.87 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0824  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.2 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  30.25 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  27.12 
 
 		 127 aa  62  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  28.35 
 
 		 131 aa  62  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1277  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0649233  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  34.19 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 127 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  35.48 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.48 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0525  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.545244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  29.06 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3086  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.916258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  27.91 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  28.93 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02492  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  35.2 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  27.73 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1659  two component transcriptional regulator  33.81 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0872  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 471 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650247 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  27.73 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1288  two component transcriptional regulator  35.48 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  27.73 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  37.7 
 
 		 1040 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4913  two component transcriptional regulator  35.48 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2856  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  28.35 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  28.93 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  28.93 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2631  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0653315 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  28.93 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  28.93 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  29.03 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  28.93 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  28.93 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  28.93 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  26.89 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  28.93 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  28.93 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  28.93 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 131 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  28.35 
 
 		 130 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.68 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  32.77 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 131 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  27.27 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  25.64 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>