28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8936 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8936  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00203567  normal  0.206926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5673  hypothetical protein  37.59 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1133  hypothetical protein  37.59 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0306591  normal  0.358452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1949  putative transcriptional regulator, XRE family  41.91 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0370256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0151  hypothetical protein  38.26 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5047  hypothetical protein  36.36 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5135  hypothetical protein  36.36 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0910615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5426  hypothetical protein  36.36 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.618223 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13885  hypothetical protein  35.38 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0121  putative transcriptional regulator, XRE family  36.69 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.179136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4134  putative DNA-binding protein  35.77 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3100  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372582  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8922  hypothetical protein  34.03 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000790719  normal  0.0561092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4197  hypothetical protein  31.47 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4027  hypothetical protein  44.68 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1548  hypothetical protein  34.07 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5076  hypothetical protein  32.52 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.650774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3238  hypothetical protein  30.95 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.677643 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2282  hypothetical protein  32.56 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.442198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1054  putative transcriptional regulator, XRE family  35.24 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0488257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5430  putative transcriptional regulator, XRE family  34.34 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26750  hypothetical protein  26.76 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1040  hypothetical protein  38.24 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4212  hypothetical protein  39.51 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4279  hypothetical protein  35.56 
 
 		 159 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2386  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 159 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256982  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4512  hypothetical protein  32.56 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>