36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3890 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  100 
 
 		 706 aa  1407    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  25.14 
 
 		 706 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  24.29 
 
 		 758 aa  143  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  24.94 
 
 		 728 aa  138  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  25.71 
 
 		 715 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  24.9 
 
 		 749 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  22.1 
 
 		 736 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  23.47 
 
 		 577 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  26.18 
 
 		 315 aa  100  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  20.31 
 
 		 862 aa  100  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  23.85 
 
 		 884 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  28.73 
 
 		 735 aa  97.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  24.29 
 
 		 784 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  24.54 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  21.96 
 
 		 976 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2072  KAP P-loop  26.98 
 
 		 997 aa  60.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.285295 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  17.95 
 
 		 672 aa  60.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1936  hypothetical protein  26.34 
 
 		 978 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000106944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  21.68 
 
 		 945 aa  58.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  23.08 
 
 		 564 aa  57  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  22.03 
 
 		 471 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  23.89 
 
 		 591 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  21.45 
 
 		 671 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  21.1 
 
 		 467 aa  52.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  25.19 
 
 		 601 aa  50.8  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  18.86 
 
 		 463 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  18.86 
 
 		 463 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  24.14 
 
 		 542 aa  50.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  29.47 
 
 		 594 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2476  KAP P-loop domain-containing protein  22.61 
 
 		 443 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  hitchhiker  0.00802204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3481  KAP P-loop domain-containing protein  22.83 
 
 		 464 aa  48.5  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0295082 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  21.84 
 
 		 571 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  25.89 
 
 		 650 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  22.14 
 
 		 622 aa  44.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  24.47 
 
 		 644 aa  44.3  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1661  twitching mobility protein  22.27 
 
 		 402 aa  44.3  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.423515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>