More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2574 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2574  Patatin  100 
 
 		 307 aa  618  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  43.42 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45660  predicted protein  24.73 
 
 		 593 aa  103  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.912846  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  27.57 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  26.53 
 
 		 422 aa  89.7  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  29.84 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  27.08 
 
 		 424 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  27.08 
 
 		 422 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  25.62 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  28.2 
 
 		 357 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  27.38 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  27.38 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  27.38 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  27.38 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  27.38 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  27.38 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  27.38 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  27.38 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  26.56 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  25.61 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  27.27 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  27.27 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  27.27 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  27.27 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  32.05 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  25.28 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  27.42 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  24.81 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  26.89 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  27.42 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  27.42 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  27.42 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  27.42 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  27.42 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  27.42 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4675  Patatin  30.59 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.0114015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  27.42 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  26.01 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  26.88 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.69 
 
 		 383 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  25.67 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  26.6 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  26.6 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  34.78 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  26.88 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  27.03 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  31.25 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  28.42 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  24.74 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  26.06 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  26.06 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  24.29 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  27.95 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  26.32 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  26.84 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  30.3 
 
 		 638 aa  68.9  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  30.38 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  32.68 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  28.21 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  26.96 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  27.57 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  29.81 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  25.26 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  27.67 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  33.15 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  27.18 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  30.2 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  30.2 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  27.18 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  24.91 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  25.98 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.86 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  29.33 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14077  predicted protein  40.78 
 
 		 594 aa  63.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  24.32 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  26.7 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  27.68 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  29.33 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  31.09 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  26.87 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  26.39 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  28.08 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  28.43 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  27.86 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  25.27 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  25.74 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  26.15 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  29.33 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  28.11 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  32.16 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  26.15 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  25.61 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  25.84 
 
 		 733 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  26.15 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  29.58 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  26.64 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  25.94 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  31.91 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  26.09 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  25.59 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>